Protein–RNA interactions for Protein: O35445

Rnf5, E3 ubiquitin-protein ligase RNF5, mousemouse

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Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf5O35445 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnf5O35445 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnf5O35445 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnf5O35445 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnf5O35445 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnf5O35445 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnf5O35445 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnf5O35445 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnf5O35445 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnf5O35445 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnf5O35445 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnf5O35445 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnf5O35445 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnf5O35445 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnf5O35445 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnf5O35445 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnf5O35445 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnf5O35445 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnf5O35445 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnf5O35445 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf5O35445 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf5O35445 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf5O35445 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf5O35445 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf5O35445 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf5O35445 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf5O35445 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf5O35445 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf5O35445 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf5O35445 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf5O35445 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf5O35445 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf5O35445 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf5O35445 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf5O35445 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf5O35445 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf5O35445 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf5O35445 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf5O35445 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf5O35445 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf5O35445 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf5O35445 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf5O35445 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf5O35445 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf5O35445 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf5O35445 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf5O35445 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf5O35445 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf5O35445 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf5O35445 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf5O35445 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf5O35445 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf5O35445 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf5O35445 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf5O35445 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf5O35445 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf5O35445 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf5O35445 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf5O35445 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf5O35445 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf5O35445 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf5O35445 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf5O35445 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf5O35445 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf5O35445 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf5O35445 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf5O35445 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf5O35445 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf5O35445 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf5O35445 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf5O35445 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf5O35445 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf5O35445 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf5O35445 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf5O35445 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf5O35445 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf5O35445 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf5O35445 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf5O35445 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf5O35445 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf5O35445 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf5O35445 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf5O35445 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf5O35445 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf5O35445 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf5O35445 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnf5O35445 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnf5O35445 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnf5O35445 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnf5O35445 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnf5O35445 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnf5O35445 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnf5O35445 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnf5O35445 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnf5O35445 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnf5O35445 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnf5O35445 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnf5O35445 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnf5O35445 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnf5O35445 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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