Protein–RNA interactions for Protein: O35405

Pld3, Phospholipase D3, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pld3O35405 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pld3O35405 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pld3O35405 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pld3O35405 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pld3O35405 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pld3O35405 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pld3O35405 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pld3O35405 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pld3O35405 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Pld3O35405 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pld3O35405 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pld3O35405 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pld3O35405 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pld3O35405 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Pld3O35405 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pld3O35405 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pld3O35405 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pld3O35405 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pld3O35405 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Pld3O35405 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pld3O35405 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pld3O35405 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pld3O35405 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pld3O35405 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pld3O35405 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pld3O35405 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pld3O35405 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pld3O35405 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pld3O35405 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pld3O35405 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pld3O35405 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pld3O35405 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pld3O35405 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pld3O35405 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pld3O35405 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pld3O35405 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pld3O35405 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pld3O35405 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pld3O35405 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pld3O35405 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pld3O35405 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pld3O35405 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pld3O35405 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pld3O35405 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
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Pld3O35405 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Pld3O35405 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Pld3O35405 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pld3O35405 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pld3O35405 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Pld3O35405 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pld3O35405 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pld3O35405 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pld3O35405 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pld3O35405 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pld3O35405 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pld3O35405 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Pld3O35405 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pld3O35405 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pld3O35405 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pld3O35405 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pld3O35405 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pld3O35405 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pld3O35405 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pld3O35405 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Pld3O35405 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Pld3O35405 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Pld3O35405 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pld3O35405 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pld3O35405 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pld3O35405 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pld3O35405 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pld3O35405 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pld3O35405 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Pld3O35405 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pld3O35405 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pld3O35405 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pld3O35405 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pld3O35405 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pld3O35405 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pld3O35405 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pld3O35405 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pld3O35405 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pld3O35405 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pld3O35405 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pld3O35405 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pld3O35405 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Pld3O35405 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pld3O35405 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pld3O35405 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Pld3O35405 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms