Protein–RNA interactions for Protein: O35326

Srsf5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf5O35326 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Srsf5O35326 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Srsf5O35326 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Srsf5O35326 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Srsf5O35326 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Srsf5O35326 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Srsf5O35326 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Srsf5O35326 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Srsf5O35326 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Srsf5O35326 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Srsf5O35326 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Srsf5O35326 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Srsf5O35326 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Srsf5O35326 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Srsf5O35326 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Srsf5O35326 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Srsf5O35326 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Srsf5O35326 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Srsf5O35326 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Srsf5O35326 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Srsf5O35326 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Srsf5O35326 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Srsf5O35326 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Srsf5O35326 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Srsf5O35326 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Srsf5O35326 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Srsf5O35326 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Srsf5O35326 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Srsf5O35326 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Srsf5O35326 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Srsf5O35326 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Srsf5O35326 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Srsf5O35326 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Srsf5O35326 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Srsf5O35326 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Srsf5O35326 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Srsf5O35326 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Srsf5O35326 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Srsf5O35326 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Srsf5O35326 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Srsf5O35326 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Srsf5O35326 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Srsf5O35326 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Srsf5O35326 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Srsf5O35326 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Srsf5O35326 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Srsf5O35326 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Srsf5O35326 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Srsf5O35326 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Srsf5O35326 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Srsf5O35326 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Srsf5O35326 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Srsf5O35326 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Srsf5O35326 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Srsf5O35326 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Srsf5O35326 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Srsf5O35326 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Srsf5O35326 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Srsf5O35326 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Srsf5O35326 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Srsf5O35326 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Srsf5O35326 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Srsf5O35326 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Srsf5O35326 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Srsf5O35326 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Srsf5O35326 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Srsf5O35326 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Srsf5O35326 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Srsf5O35326 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Srsf5O35326 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Srsf5O35326 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Srsf5O35326 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Srsf5O35326 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Srsf5O35326 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Srsf5O35326 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Srsf5O35326 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Srsf5O35326 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Srsf5O35326 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Srsf5O35326 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Srsf5O35326 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Srsf5O35326 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Srsf5O35326 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Srsf5O35326 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Srsf5O35326 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Srsf5O35326 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Srsf5O35326 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Srsf5O35326 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Srsf5O35326 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Srsf5O35326 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Srsf5O35326 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Srsf5O35326 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Srsf5O35326 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Srsf5O35326 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Srsf5O35326 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Srsf5O35326 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Srsf5O35326 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Srsf5O35326 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Srsf5O35326 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Srsf5O35326 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Srsf5O35326 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms