Protein–RNA interactions for Protein: O35310

Hs3st1, Heparan sulfate glucosamine 3-O-sulfotransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hs3st1O35310 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hs3st1O35310 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hs3st1O35310 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hs3st1O35310 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Hs3st1O35310 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Hs3st1O35310 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Hs3st1O35310 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Hs3st1O35310 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hs3st1O35310 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hs3st1O35310 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hs3st1O35310 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hs3st1O35310 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Hs3st1O35310 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hs3st1O35310 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hs3st1O35310 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hs3st1O35310 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hs3st1O35310 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hs3st1O35310 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hs3st1O35310 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hs3st1O35310 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hs3st1O35310 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hs3st1O35310 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hs3st1O35310 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hs3st1O35310 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hs3st1O35310 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Hs3st1O35310 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hs3st1O35310 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hs3st1O35310 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hs3st1O35310 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hs3st1O35310 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hs3st1O35310 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hs3st1O35310 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hs3st1O35310 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hs3st1O35310 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hs3st1O35310 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hs3st1O35310 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hs3st1O35310 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hs3st1O35310 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hs3st1O35310 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hs3st1O35310 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hs3st1O35310 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hs3st1O35310 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hs3st1O35310 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hs3st1O35310 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Hs3st1O35310 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hs3st1O35310 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hs3st1O35310 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hs3st1O35310 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hs3st1O35310 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hs3st1O35310 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hs3st1O35310 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hs3st1O35310 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hs3st1O35310 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hs3st1O35310 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hs3st1O35310 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hs3st1O35310 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hs3st1O35310 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hs3st1O35310 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hs3st1O35310 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hs3st1O35310 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hs3st1O35310 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hs3st1O35310 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Hs3st1O35310 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Hs3st1O35310 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hs3st1O35310 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hs3st1O35310 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hs3st1O35310 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hs3st1O35310 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hs3st1O35310 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hs3st1O35310 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hs3st1O35310 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hs3st1O35310 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hs3st1O35310 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hs3st1O35310 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Hs3st1O35310 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Hs3st1O35310 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hs3st1O35310 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hs3st1O35310 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hs3st1O35310 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hs3st1O35310 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hs3st1O35310 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hs3st1O35310 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hs3st1O35310 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hs3st1O35310 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hs3st1O35310 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hs3st1O35310 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hs3st1O35310 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hs3st1O35310 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hs3st1O35310 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hs3st1O35310 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hs3st1O35310 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hs3st1O35310 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hs3st1O35310 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hs3st1O35310 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hs3st1O35310 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hs3st1O35310 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hs3st1O35310 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hs3st1O35310 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hs3st1O35310 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hs3st1O35310 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms