Protein–RNA interactions for Protein: O35261

E2f3, Transcription factor E2F3, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f3O35261 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
E2f3O35261 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
E2f3O35261 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
E2f3O35261 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
E2f3O35261 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
E2f3O35261 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
E2f3O35261 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
E2f3O35261 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
E2f3O35261 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
E2f3O35261 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
E2f3O35261 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
E2f3O35261 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
E2f3O35261 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
E2f3O35261 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
E2f3O35261 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
E2f3O35261 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
E2f3O35261 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
E2f3O35261 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
E2f3O35261 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
E2f3O35261 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
E2f3O35261 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
E2f3O35261 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
E2f3O35261 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
E2f3O35261 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
E2f3O35261 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
E2f3O35261 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
E2f3O35261 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
E2f3O35261 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
E2f3O35261 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
E2f3O35261 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
E2f3O35261 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
E2f3O35261 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
E2f3O35261 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
E2f3O35261 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
E2f3O35261 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
E2f3O35261 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
E2f3O35261 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
E2f3O35261 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
E2f3O35261 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
E2f3O35261 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
E2f3O35261 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
E2f3O35261 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
E2f3O35261 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
E2f3O35261 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
E2f3O35261 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
E2f3O35261 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
E2f3O35261 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
E2f3O35261 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
E2f3O35261 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
E2f3O35261 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
E2f3O35261 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
E2f3O35261 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
E2f3O35261 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
E2f3O35261 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
E2f3O35261 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
E2f3O35261 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
E2f3O35261 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
E2f3O35261 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
E2f3O35261 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
E2f3O35261 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
E2f3O35261 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
E2f3O35261 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
E2f3O35261 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
E2f3O35261 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
E2f3O35261 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
E2f3O35261 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
E2f3O35261 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
E2f3O35261 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
E2f3O35261 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
E2f3O35261 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
E2f3O35261 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
E2f3O35261 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
E2f3O35261 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
E2f3O35261 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
E2f3O35261 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
E2f3O35261 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
E2f3O35261 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
E2f3O35261 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
E2f3O35261 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
E2f3O35261 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
E2f3O35261 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
E2f3O35261 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
E2f3O35261 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
E2f3O35261 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
E2f3O35261 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
E2f3O35261 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
E2f3O35261 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
E2f3O35261 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
E2f3O35261 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
E2f3O35261 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
E2f3O35261 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
E2f3O35261 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
E2f3O35261 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
E2f3O35261 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
E2f3O35261 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
E2f3O35261 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
E2f3O35261 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
E2f3O35261 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
E2f3O35261 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
E2f3O35261 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms