Protein–RNA interactions for Protein: O35160

Pitx3, Pituitary homeobox 3, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx3O35160 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pitx3O35160 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pitx3O35160 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pitx3O35160 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pitx3O35160 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pitx3O35160 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pitx3O35160 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pitx3O35160 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pitx3O35160 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pitx3O35160 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pitx3O35160 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pitx3O35160 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pitx3O35160 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pitx3O35160 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pitx3O35160 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pitx3O35160 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Pitx3O35160 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pitx3O35160 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pitx3O35160 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pitx3O35160 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pitx3O35160 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pitx3O35160 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pitx3O35160 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pitx3O35160 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pitx3O35160 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pitx3O35160 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pitx3O35160 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pitx3O35160 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pitx3O35160 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pitx3O35160 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pitx3O35160 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pitx3O35160 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pitx3O35160 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pitx3O35160 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pitx3O35160 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pitx3O35160 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pitx3O35160 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pitx3O35160 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pitx3O35160 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pitx3O35160 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pitx3O35160 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pitx3O35160 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pitx3O35160 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Pitx3O35160 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pitx3O35160 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pitx3O35160 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pitx3O35160 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pitx3O35160 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pitx3O35160 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Pitx3O35160 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Pitx3O35160 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Pitx3O35160 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pitx3O35160 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pitx3O35160 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pitx3O35160 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pitx3O35160 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pitx3O35160 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pitx3O35160 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pitx3O35160 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pitx3O35160 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pitx3O35160 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pitx3O35160 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pitx3O35160 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pitx3O35160 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pitx3O35160 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pitx3O35160 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pitx3O35160 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pitx3O35160 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pitx3O35160 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pitx3O35160 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pitx3O35160 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pitx3O35160 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pitx3O35160 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pitx3O35160 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pitx3O35160 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pitx3O35160 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pitx3O35160 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pitx3O35160 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pitx3O35160 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pitx3O35160 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pitx3O35160 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pitx3O35160 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pitx3O35160 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pitx3O35160 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pitx3O35160 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pitx3O35160 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pitx3O35160 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pitx3O35160 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pitx3O35160 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pitx3O35160 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pitx3O35160 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pitx3O35160 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pitx3O35160 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pitx3O35160 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pitx3O35160 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pitx3O35160 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pitx3O35160 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pitx3O35160 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pitx3O35160 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pitx3O35160 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms