Protein–RNA interactions for Protein: O35085

Arx, Homeobox protein ARX, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ArxO35085 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ArxO35085 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ArxO35085 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ArxO35085 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ArxO35085 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ArxO35085 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ArxO35085 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ArxO35085 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
ArxO35085 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ArxO35085 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ArxO35085 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ArxO35085 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ArxO35085 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ArxO35085 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ArxO35085 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ArxO35085 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ArxO35085 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ArxO35085 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ArxO35085 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ArxO35085 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ArxO35085 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ArxO35085 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ArxO35085 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ArxO35085 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ArxO35085 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ArxO35085 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
ArxO35085 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ArxO35085 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ArxO35085 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ArxO35085 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
ArxO35085 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ArxO35085 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ArxO35085 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ArxO35085 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ArxO35085 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ArxO35085 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ArxO35085 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ArxO35085 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ArxO35085 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ArxO35085 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ArxO35085 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
ArxO35085 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ArxO35085 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ArxO35085 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ArxO35085 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
ArxO35085 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ArxO35085 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ArxO35085 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ArxO35085 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ArxO35085 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ArxO35085 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ArxO35085 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ArxO35085 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ArxO35085 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ArxO35085 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ArxO35085 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ArxO35085 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ArxO35085 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ArxO35085 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ArxO35085 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
ArxO35085 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ArxO35085 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ArxO35085 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ArxO35085 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ArxO35085 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ArxO35085 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ArxO35085 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ArxO35085 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ArxO35085 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ArxO35085 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ArxO35085 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ArxO35085 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ArxO35085 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ArxO35085 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ArxO35085 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ArxO35085 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
ArxO35085 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ArxO35085 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
ArxO35085 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ArxO35085 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ArxO35085 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ArxO35085 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ArxO35085 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ArxO35085 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ArxO35085 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ArxO35085 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ArxO35085 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ArxO35085 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ArxO35085 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ArxO35085 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ArxO35085 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ArxO35085 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ArxO35085 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ArxO35085 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ArxO35085 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ArxO35085 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ArxO35085 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ArxO35085 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ArxO35085 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ArxO35085 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
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