Protein–RNA interactions for Protein: O35066

Kif3c, Kinesin-like protein KIF3C, mousemouse

Predictions only

Length 796 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif3cO35066 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Kif3cO35066 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Kif3cO35066 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Kif3cO35066 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Kif3cO35066 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Kif3cO35066 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Kif3cO35066 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Kif3cO35066 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Kif3cO35066 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Kif3cO35066 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Kif3cO35066 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Kif3cO35066 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Kif3cO35066 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Kif3cO35066 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Kif3cO35066 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Kif3cO35066 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Kif3cO35066 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Kif3cO35066 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Kif3cO35066 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Kif3cO35066 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kif3cO35066 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kif3cO35066 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kif3cO35066 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kif3cO35066 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kif3cO35066 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kif3cO35066 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kif3cO35066 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kif3cO35066 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kif3cO35066 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kif3cO35066 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kif3cO35066 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kif3cO35066 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kif3cO35066 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kif3cO35066 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kif3cO35066 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kif3cO35066 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kif3cO35066 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Kif3cO35066 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Kif3cO35066 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Kif3cO35066 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Kif3cO35066 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Kif3cO35066 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Kif3cO35066 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Kif3cO35066 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Kif3cO35066 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Kif3cO35066 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Kif3cO35066 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Kif3cO35066 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Kif3cO35066 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Kif3cO35066 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Kif3cO35066 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Kif3cO35066 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Kif3cO35066 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Kif3cO35066 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Kif3cO35066 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Kif3cO35066 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Kif3cO35066 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Kif3cO35066 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Kif3cO35066 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Kif3cO35066 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Kif3cO35066 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kif3cO35066 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kif3cO35066 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kif3cO35066 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kif3cO35066 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kif3cO35066 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kif3cO35066 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kif3cO35066 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kif3cO35066 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kif3cO35066 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kif3cO35066 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kif3cO35066 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kif3cO35066 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kif3cO35066 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kif3cO35066 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Kif3cO35066 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kif3cO35066 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kif3cO35066 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kif3cO35066 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kif3cO35066 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kif3cO35066 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kif3cO35066 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kif3cO35066 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kif3cO35066 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Kif3cO35066 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Kif3cO35066 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Kif3cO35066 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Kif3cO35066 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Kif3cO35066 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Kif3cO35066 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Kif3cO35066 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Kif3cO35066 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Kif3cO35066 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Kif3cO35066 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Kif3cO35066 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Kif3cO35066 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Kif3cO35066 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Kif3cO35066 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Kif3cO35066 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Kif3cO35066 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms