Protein–RNA interactions for Protein: M0QWN7

Usp35, Ubiquitin-specific peptidase 35, mousemouse

Predictions only

Length 1,009 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp35M0QWN7 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp35M0QWN7 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp35M0QWN7 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp35M0QWN7 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp35M0QWN7 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp35M0QWN7 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp35M0QWN7 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp35M0QWN7 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp35M0QWN7 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp35M0QWN7 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp35M0QWN7 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp35M0QWN7 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp35M0QWN7 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp35M0QWN7 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp35M0QWN7 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp35M0QWN7 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp35M0QWN7 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp35M0QWN7 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp35M0QWN7 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp35M0QWN7 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp35M0QWN7 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp35M0QWN7 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp35M0QWN7 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp35M0QWN7 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp35M0QWN7 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp35M0QWN7 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp35M0QWN7 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp35M0QWN7 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp35M0QWN7 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp35M0QWN7 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp35M0QWN7 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp35M0QWN7 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp35M0QWN7 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp35M0QWN7 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp35M0QWN7 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp35M0QWN7 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp35M0QWN7 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp35M0QWN7 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp35M0QWN7 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp35M0QWN7 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp35M0QWN7 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp35M0QWN7 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp35M0QWN7 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp35M0QWN7 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp35M0QWN7 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp35M0QWN7 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp35M0QWN7 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp35M0QWN7 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp35M0QWN7 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp35M0QWN7 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp35M0QWN7 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp35M0QWN7 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp35M0QWN7 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp35M0QWN7 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp35M0QWN7 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp35M0QWN7 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp35M0QWN7 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp35M0QWN7 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp35M0QWN7 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp35M0QWN7 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp35M0QWN7 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp35M0QWN7 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp35M0QWN7 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp35M0QWN7 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp35M0QWN7 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp35M0QWN7 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp35M0QWN7 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp35M0QWN7 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp35M0QWN7 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp35M0QWN7 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp35M0QWN7 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp35M0QWN7 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp35M0QWN7 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp35M0QWN7 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp35M0QWN7 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp35M0QWN7 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp35M0QWN7 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp35M0QWN7 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp35M0QWN7 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp35M0QWN7 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp35M0QWN7 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp35M0QWN7 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp35M0QWN7 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp35M0QWN7 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp35M0QWN7 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp35M0QWN7 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp35M0QWN7 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp35M0QWN7 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp35M0QWN7 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp35M0QWN7 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp35M0QWN7 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp35M0QWN7 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp35M0QWN7 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp35M0QWN7 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp35M0QWN7 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp35M0QWN7 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp35M0QWN7 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp35M0QWN7 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp35M0QWN7 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp35M0QWN7 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms