Protein–RNA interactions for Protein: J3QPU5

Ccer2, Coiled-coil glutamate-rich protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer2J3QPU5 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccer2J3QPU5 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccer2J3QPU5 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccer2J3QPU5 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccer2J3QPU5 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccer2J3QPU5 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccer2J3QPU5 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccer2J3QPU5 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccer2J3QPU5 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccer2J3QPU5 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccer2J3QPU5 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccer2J3QPU5 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccer2J3QPU5 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccer2J3QPU5 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccer2J3QPU5 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccer2J3QPU5 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccer2J3QPU5 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccer2J3QPU5 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccer2J3QPU5 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccer2J3QPU5 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ccer2J3QPU5 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ccer2J3QPU5 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ccer2J3QPU5 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccer2J3QPU5 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccer2J3QPU5 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccer2J3QPU5 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccer2J3QPU5 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccer2J3QPU5 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccer2J3QPU5 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccer2J3QPU5 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccer2J3QPU5 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccer2J3QPU5 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccer2J3QPU5 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccer2J3QPU5 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccer2J3QPU5 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccer2J3QPU5 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccer2J3QPU5 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccer2J3QPU5 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccer2J3QPU5 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccer2J3QPU5 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccer2J3QPU5 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccer2J3QPU5 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccer2J3QPU5 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccer2J3QPU5 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccer2J3QPU5 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccer2J3QPU5 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccer2J3QPU5 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccer2J3QPU5 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccer2J3QPU5 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccer2J3QPU5 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccer2J3QPU5 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccer2J3QPU5 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccer2J3QPU5 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccer2J3QPU5 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccer2J3QPU5 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccer2J3QPU5 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccer2J3QPU5 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccer2J3QPU5 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccer2J3QPU5 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccer2J3QPU5 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccer2J3QPU5 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccer2J3QPU5 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccer2J3QPU5 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccer2J3QPU5 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccer2J3QPU5 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccer2J3QPU5 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccer2J3QPU5 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccer2J3QPU5 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccer2J3QPU5 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccer2J3QPU5 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccer2J3QPU5 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccer2J3QPU5 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccer2J3QPU5 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccer2J3QPU5 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccer2J3QPU5 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccer2J3QPU5 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccer2J3QPU5 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccer2J3QPU5 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccer2J3QPU5 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccer2J3QPU5 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccer2J3QPU5 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccer2J3QPU5 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccer2J3QPU5 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccer2J3QPU5 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccer2J3QPU5 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccer2J3QPU5 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccer2J3QPU5 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccer2J3QPU5 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccer2J3QPU5 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccer2J3QPU5 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccer2J3QPU5 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccer2J3QPU5 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccer2J3QPU5 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccer2J3QPU5 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccer2J3QPU5 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccer2J3QPU5 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccer2J3QPU5 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccer2J3QPU5 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccer2J3QPU5 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccer2J3QPU5 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.3 ms