Protein–RNA interactions for Protein: J3QPL3

Gm5225, Predicted gene 5225, mousemouse

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Length 108 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5225J3QPL3 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm5225J3QPL3 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm5225J3QPL3 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm5225J3QPL3 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm5225J3QPL3 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm5225J3QPL3 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm5225J3QPL3 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm5225J3QPL3 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm5225J3QPL3 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm5225J3QPL3 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm5225J3QPL3 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm5225J3QPL3 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm5225J3QPL3 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm5225J3QPL3 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm5225J3QPL3 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm5225J3QPL3 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm5225J3QPL3 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm5225J3QPL3 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm5225J3QPL3 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm5225J3QPL3 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm5225J3QPL3 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm5225J3QPL3 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm5225J3QPL3 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm5225J3QPL3 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm5225J3QPL3 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm5225J3QPL3 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm5225J3QPL3 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm5225J3QPL3 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm5225J3QPL3 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm5225J3QPL3 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm5225J3QPL3 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm5225J3QPL3 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm5225J3QPL3 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm5225J3QPL3 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm5225J3QPL3 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm5225J3QPL3 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm5225J3QPL3 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm5225J3QPL3 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm5225J3QPL3 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm5225J3QPL3 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm5225J3QPL3 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm5225J3QPL3 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm5225J3QPL3 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm5225J3QPL3 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm5225J3QPL3 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm5225J3QPL3 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm5225J3QPL3 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm5225J3QPL3 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm5225J3QPL3 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm5225J3QPL3 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm5225J3QPL3 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm5225J3QPL3 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm5225J3QPL3 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm5225J3QPL3 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm5225J3QPL3 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm5225J3QPL3 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm5225J3QPL3 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm5225J3QPL3 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm5225J3QPL3 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm5225J3QPL3 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm5225J3QPL3 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm5225J3QPL3 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm5225J3QPL3 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm5225J3QPL3 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm5225J3QPL3 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm5225J3QPL3 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm5225J3QPL3 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm5225J3QPL3 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm5225J3QPL3 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm5225J3QPL3 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm5225J3QPL3 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm5225J3QPL3 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm5225J3QPL3 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm5225J3QPL3 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm5225J3QPL3 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm5225J3QPL3 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm5225J3QPL3 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm5225J3QPL3 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm5225J3QPL3 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm5225J3QPL3 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm5225J3QPL3 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm5225J3QPL3 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm5225J3QPL3 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm5225J3QPL3 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm5225J3QPL3 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm5225J3QPL3 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm5225J3QPL3 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm5225J3QPL3 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm5225J3QPL3 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm5225J3QPL3 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm5225J3QPL3 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm5225J3QPL3 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm5225J3QPL3 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm5225J3QPL3 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm5225J3QPL3 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm5225J3QPL3 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm5225J3QPL3 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm5225J3QPL3 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm5225J3QPL3 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm5225J3QPL3 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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