Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP9

Fam240a, Family with sequence similarity 240 member A, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam240aJ3QNP9 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Fam240aJ3QNP9 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Fam240aJ3QNP9 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Fam240aJ3QNP9 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Fam240aJ3QNP9 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Fam240aJ3QNP9 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Fam240aJ3QNP9 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Fam240aJ3QNP9 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Fam240aJ3QNP9 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Fam240aJ3QNP9 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Fam240aJ3QNP9 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Fam240aJ3QNP9 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Fam240aJ3QNP9 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Fam240aJ3QNP9 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Fam240aJ3QNP9 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Fam240aJ3QNP9 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Fam240aJ3QNP9 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Fam240aJ3QNP9 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Fam240aJ3QNP9 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Fam240aJ3QNP9 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Fam240aJ3QNP9 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Fam240aJ3QNP9 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Fam240aJ3QNP9 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Fam240aJ3QNP9 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Fam240aJ3QNP9 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Fam240aJ3QNP9 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Fam240aJ3QNP9 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Fam240aJ3QNP9 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Fam240aJ3QNP9 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Fam240aJ3QNP9 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Fam240aJ3QNP9 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Fam240aJ3QNP9 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Fam240aJ3QNP9 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Fam240aJ3QNP9 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Fam240aJ3QNP9 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Fam240aJ3QNP9 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Fam240aJ3QNP9 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Fam240aJ3QNP9 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Fam240aJ3QNP9 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Fam240aJ3QNP9 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Fam240aJ3QNP9 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Fam240aJ3QNP9 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Fam240aJ3QNP9 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Fam240aJ3QNP9 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Fam240aJ3QNP9 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Fam240aJ3QNP9 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Fam240aJ3QNP9 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Fam240aJ3QNP9 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Fam240aJ3QNP9 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Fam240aJ3QNP9 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Fam240aJ3QNP9 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Fam240aJ3QNP9 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Fam240aJ3QNP9 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Fam240aJ3QNP9 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Fam240aJ3QNP9 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Fam240aJ3QNP9 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Fam240aJ3QNP9 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Fam240aJ3QNP9 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Fam240aJ3QNP9 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Fam240aJ3QNP9 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Fam240aJ3QNP9 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Fam240aJ3QNP9 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Fam240aJ3QNP9 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC12□□□□□ -0.49
Fam240aJ3QNP9 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Fam240aJ3QNP9 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Fam240aJ3QNP9 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Fam240aJ3QNP9 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Fam240aJ3QNP9 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Fam240aJ3QNP9 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Fam240aJ3QNP9 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Fam240aJ3QNP9 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Fam240aJ3QNP9 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Fam240aJ3QNP9 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Fam240aJ3QNP9 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Fam240aJ3QNP9 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Fam240aJ3QNP9 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Fam240aJ3QNP9 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Fam240aJ3QNP9 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Fam240aJ3QNP9 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Fam240aJ3QNP9 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Fam240aJ3QNP9 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Fam240aJ3QNP9 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Fam240aJ3QNP9 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Fam240aJ3QNP9 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Fam240aJ3QNP9 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Fam240aJ3QNP9 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Fam240aJ3QNP9 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Fam240aJ3QNP9 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Fam240aJ3QNP9 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Fam240aJ3QNP9 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Fam240aJ3QNP9 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Fam240aJ3QNP9 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Fam240aJ3QNP9 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Fam240aJ3QNP9 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Fam240aJ3QNP9 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Fam240aJ3QNP9 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Fam240aJ3QNP9 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Fam240aJ3QNP9 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Fam240aJ3QNP9 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Fam240aJ3QNP9 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms