Protein–RNA interactions for Protein: J3QN84

Gm21812, Predicted gene, 21812, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21812J3QN84 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm21812J3QN84 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm21812J3QN84 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm21812J3QN84 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm21812J3QN84 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm21812J3QN84 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm21812J3QN84 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm21812J3QN84 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm21812J3QN84 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm21812J3QN84 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm21812J3QN84 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm21812J3QN84 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm21812J3QN84 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm21812J3QN84 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm21812J3QN84 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm21812J3QN84 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm21812J3QN84 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm21812J3QN84 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm21812J3QN84 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm21812J3QN84 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm21812J3QN84 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm21812J3QN84 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm21812J3QN84 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm21812J3QN84 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm21812J3QN84 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm21812J3QN84 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm21812J3QN84 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm21812J3QN84 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm21812J3QN84 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm21812J3QN84 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm21812J3QN84 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm21812J3QN84 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm21812J3QN84 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm21812J3QN84 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm21812J3QN84 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm21812J3QN84 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm21812J3QN84 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm21812J3QN84 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm21812J3QN84 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm21812J3QN84 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm21812J3QN84 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm21812J3QN84 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm21812J3QN84 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm21812J3QN84 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm21812J3QN84 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm21812J3QN84 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm21812J3QN84 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm21812J3QN84 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm21812J3QN84 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm21812J3QN84 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm21812J3QN84 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm21812J3QN84 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm21812J3QN84 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm21812J3QN84 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm21812J3QN84 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm21812J3QN84 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm21812J3QN84 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm21812J3QN84 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm21812J3QN84 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm21812J3QN84 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm21812J3QN84 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm21812J3QN84 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm21812J3QN84 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm21812J3QN84 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm21812J3QN84 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm21812J3QN84 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm21812J3QN84 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm21812J3QN84 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm21812J3QN84 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm21812J3QN84 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm21812J3QN84 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm21812J3QN84 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm21812J3QN84 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm21812J3QN84 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm21812J3QN84 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm21812J3QN84 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm21812J3QN84 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm21812J3QN84 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm21812J3QN84 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm21812J3QN84 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm21812J3QN84 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm21812J3QN84 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm21812J3QN84 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm21812J3QN84 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm21812J3QN84 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm21812J3QN84 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm21812J3QN84 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm21812J3QN84 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm21812J3QN84 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm21812J3QN84 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm21812J3QN84 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm21812J3QN84 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm21812J3QN84 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm21812J3QN84 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm21812J3QN84 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm21812J3QN84 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm21812J3QN84 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm21812J3QN84 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm21812J3QN84 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm21812J3QN84 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms