Protein–RNA interactions for Protein: J3QM43

Gm6594, Predicted pseudogene 6594, mousemouse

Predictions only

Length 95 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6594J3QM43 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm6594J3QM43 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm6594J3QM43 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm6594J3QM43 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm6594J3QM43 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm6594J3QM43 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm6594J3QM43 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm6594J3QM43 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm6594J3QM43 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm6594J3QM43 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm6594J3QM43 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm6594J3QM43 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm6594J3QM43 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm6594J3QM43 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm6594J3QM43 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm6594J3QM43 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm6594J3QM43 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm6594J3QM43 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm6594J3QM43 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm6594J3QM43 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm6594J3QM43 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm6594J3QM43 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm6594J3QM43 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm6594J3QM43 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm6594J3QM43 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm6594J3QM43 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm6594J3QM43 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm6594J3QM43 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm6594J3QM43 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm6594J3QM43 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm6594J3QM43 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm6594J3QM43 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm6594J3QM43 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm6594J3QM43 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm6594J3QM43 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm6594J3QM43 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm6594J3QM43 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm6594J3QM43 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm6594J3QM43 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm6594J3QM43 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm6594J3QM43 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Gm6594J3QM43 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Gm6594J3QM43 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Gm6594J3QM43 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm6594J3QM43 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm6594J3QM43 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm6594J3QM43 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm6594J3QM43 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm6594J3QM43 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm6594J3QM43 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm6594J3QM43 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm6594J3QM43 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm6594J3QM43 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm6594J3QM43 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm6594J3QM43 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm6594J3QM43 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm6594J3QM43 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm6594J3QM43 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm6594J3QM43 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm6594J3QM43 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm6594J3QM43 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm6594J3QM43 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm6594J3QM43 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm6594J3QM43 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm6594J3QM43 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm6594J3QM43 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm6594J3QM43 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm6594J3QM43 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm6594J3QM43 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm6594J3QM43 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm6594J3QM43 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm6594J3QM43 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm6594J3QM43 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm6594J3QM43 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm6594J3QM43 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm6594J3QM43 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm6594J3QM43 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm6594J3QM43 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm6594J3QM43 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm6594J3QM43 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm6594J3QM43 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm6594J3QM43 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm6594J3QM43 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm6594J3QM43 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm6594J3QM43 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm6594J3QM43 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm6594J3QM43 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm6594J3QM43 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm6594J3QM43 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm6594J3QM43 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm6594J3QM43 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm6594J3QM43 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm6594J3QM43 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm6594J3QM43 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm6594J3QM43 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm6594J3QM43 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm6594J3QM43 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm6594J3QM43 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm6594J3QM43 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm6594J3QM43 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms