Protein–RNA interactions for Protein: J3QJX6

7530416G11Rik, RIKEN cDNA 7530416G11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
7530416G11RikJ3QJX6 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
7530416G11RikJ3QJX6 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
7530416G11RikJ3QJX6 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
7530416G11RikJ3QJX6 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
7530416G11RikJ3QJX6 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
7530416G11RikJ3QJX6 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
7530416G11RikJ3QJX6 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
7530416G11RikJ3QJX6 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
7530416G11RikJ3QJX6 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
7530416G11RikJ3QJX6 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
7530416G11RikJ3QJX6 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
7530416G11RikJ3QJX6 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
7530416G11RikJ3QJX6 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
7530416G11RikJ3QJX6 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
7530416G11RikJ3QJX6 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
7530416G11RikJ3QJX6 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
7530416G11RikJ3QJX6 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
7530416G11RikJ3QJX6 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
7530416G11RikJ3QJX6 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
7530416G11RikJ3QJX6 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
7530416G11RikJ3QJX6 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
7530416G11RikJ3QJX6 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
7530416G11RikJ3QJX6 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
7530416G11RikJ3QJX6 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
7530416G11RikJ3QJX6 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
7530416G11RikJ3QJX6 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
7530416G11RikJ3QJX6 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
7530416G11RikJ3QJX6 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
7530416G11RikJ3QJX6 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
7530416G11RikJ3QJX6 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
7530416G11RikJ3QJX6 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
7530416G11RikJ3QJX6 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
7530416G11RikJ3QJX6 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
7530416G11RikJ3QJX6 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
7530416G11RikJ3QJX6 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
7530416G11RikJ3QJX6 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
7530416G11RikJ3QJX6 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
7530416G11RikJ3QJX6 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
7530416G11RikJ3QJX6 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
7530416G11RikJ3QJX6 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
7530416G11RikJ3QJX6 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
7530416G11RikJ3QJX6 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
7530416G11RikJ3QJX6 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
7530416G11RikJ3QJX6 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
7530416G11RikJ3QJX6 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
7530416G11RikJ3QJX6 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
7530416G11RikJ3QJX6 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
7530416G11RikJ3QJX6 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
7530416G11RikJ3QJX6 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
7530416G11RikJ3QJX6 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
7530416G11RikJ3QJX6 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
7530416G11RikJ3QJX6 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
7530416G11RikJ3QJX6 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
7530416G11RikJ3QJX6 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
7530416G11RikJ3QJX6 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
7530416G11RikJ3QJX6 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
7530416G11RikJ3QJX6 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
7530416G11RikJ3QJX6 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
7530416G11RikJ3QJX6 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
7530416G11RikJ3QJX6 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
7530416G11RikJ3QJX6 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
7530416G11RikJ3QJX6 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
7530416G11RikJ3QJX6 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
7530416G11RikJ3QJX6 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
7530416G11RikJ3QJX6 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
7530416G11RikJ3QJX6 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
7530416G11RikJ3QJX6 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
7530416G11RikJ3QJX6 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
7530416G11RikJ3QJX6 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
7530416G11RikJ3QJX6 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
7530416G11RikJ3QJX6 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
7530416G11RikJ3QJX6 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
7530416G11RikJ3QJX6 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
7530416G11RikJ3QJX6 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
7530416G11RikJ3QJX6 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
7530416G11RikJ3QJX6 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
7530416G11RikJ3QJX6 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
7530416G11RikJ3QJX6 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
7530416G11RikJ3QJX6 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
7530416G11RikJ3QJX6 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
7530416G11RikJ3QJX6 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
7530416G11RikJ3QJX6 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
7530416G11RikJ3QJX6 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
7530416G11RikJ3QJX6 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
7530416G11RikJ3QJX6 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
7530416G11RikJ3QJX6 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
7530416G11RikJ3QJX6 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
7530416G11RikJ3QJX6 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
7530416G11RikJ3QJX6 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
7530416G11RikJ3QJX6 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
7530416G11RikJ3QJX6 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
7530416G11RikJ3QJX6 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
7530416G11RikJ3QJX6 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
7530416G11RikJ3QJX6 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
7530416G11RikJ3QJX6 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
7530416G11RikJ3QJX6 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
7530416G11RikJ3QJX6 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
7530416G11RikJ3QJX6 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
7530416G11RikJ3QJX6 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
7530416G11RikJ3QJX6 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms