Protein–RNA interactions for Protein: J3KML6

Gm20830, Predicted gene, 20830, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20830J3KML6 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm20830J3KML6 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm20830J3KML6 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm20830J3KML6 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm20830J3KML6 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm20830J3KML6 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm20830J3KML6 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm20830J3KML6 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm20830J3KML6 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm20830J3KML6 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm20830J3KML6 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm20830J3KML6 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm20830J3KML6 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm20830J3KML6 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm20830J3KML6 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm20830J3KML6 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm20830J3KML6 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm20830J3KML6 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm20830J3KML6 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm20830J3KML6 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm20830J3KML6 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm20830J3KML6 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm20830J3KML6 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm20830J3KML6 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm20830J3KML6 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm20830J3KML6 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm20830J3KML6 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm20830J3KML6 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm20830J3KML6 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm20830J3KML6 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm20830J3KML6 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm20830J3KML6 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm20830J3KML6 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm20830J3KML6 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm20830J3KML6 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm20830J3KML6 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm20830J3KML6 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm20830J3KML6 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm20830J3KML6 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm20830J3KML6 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm20830J3KML6 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm20830J3KML6 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm20830J3KML6 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm20830J3KML6 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm20830J3KML6 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.23
Gm20830J3KML6 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20830J3KML6 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20830J3KML6 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20830J3KML6 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20830J3KML6 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20830J3KML6 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20830J3KML6 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20830J3KML6 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20830J3KML6 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20830J3KML6 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20830J3KML6 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20830J3KML6 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20830J3KML6 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20830J3KML6 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20830J3KML6 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20830J3KML6 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20830J3KML6 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20830J3KML6 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20830J3KML6 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20830J3KML6 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20830J3KML6 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20830J3KML6 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20830J3KML6 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20830J3KML6 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20830J3KML6 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20830J3KML6 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20830J3KML6 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20830J3KML6 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm20830J3KML6 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm20830J3KML6 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm20830J3KML6 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm20830J3KML6 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm20830J3KML6 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm20830J3KML6 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm20830J3KML6 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm20830J3KML6 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm20830J3KML6 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm20830J3KML6 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm20830J3KML6 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm20830J3KML6 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm20830J3KML6 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm20830J3KML6 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm20830J3KML6 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm20830J3KML6 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm20830J3KML6 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm20830J3KML6 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm20830J3KML6 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm20830J3KML6 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm20830J3KML6 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm20830J3KML6 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm20830J3KML6 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm20830J3KML6 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm20830J3KML6 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm20830J3KML6 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm20830J3KML6 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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