Protein–RNA interactions for Protein: G5E8X2

Pabpc4l, MCG12357, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc4lG5E8X2 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pabpc4lG5E8X2 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pabpc4lG5E8X2 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pabpc4lG5E8X2 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pabpc4lG5E8X2 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pabpc4lG5E8X2 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pabpc4lG5E8X2 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pabpc4lG5E8X2 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pabpc4lG5E8X2 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pabpc4lG5E8X2 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pabpc4lG5E8X2 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pabpc4lG5E8X2 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pabpc4lG5E8X2 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pabpc4lG5E8X2 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pabpc4lG5E8X2 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pabpc4lG5E8X2 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pabpc4lG5E8X2 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Pabpc4lG5E8X2 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pabpc4lG5E8X2 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pabpc4lG5E8X2 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pabpc4lG5E8X2 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pabpc4lG5E8X2 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pabpc4lG5E8X2 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pabpc4lG5E8X2 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pabpc4lG5E8X2 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pabpc4lG5E8X2 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pabpc4lG5E8X2 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Pabpc4lG5E8X2 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Pabpc4lG5E8X2 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pabpc4lG5E8X2 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pabpc4lG5E8X2 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pabpc4lG5E8X2 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Pabpc4lG5E8X2 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pabpc4lG5E8X2 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pabpc4lG5E8X2 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pabpc4lG5E8X2 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pabpc4lG5E8X2 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pabpc4lG5E8X2 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pabpc4lG5E8X2 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pabpc4lG5E8X2 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pabpc4lG5E8X2 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pabpc4lG5E8X2 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pabpc4lG5E8X2 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pabpc4lG5E8X2 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pabpc4lG5E8X2 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pabpc4lG5E8X2 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pabpc4lG5E8X2 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pabpc4lG5E8X2 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pabpc4lG5E8X2 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pabpc4lG5E8X2 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pabpc4lG5E8X2 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pabpc4lG5E8X2 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pabpc4lG5E8X2 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pabpc4lG5E8X2 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pabpc4lG5E8X2 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pabpc4lG5E8X2 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pabpc4lG5E8X2 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pabpc4lG5E8X2 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pabpc4lG5E8X2 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pabpc4lG5E8X2 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pabpc4lG5E8X2 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pabpc4lG5E8X2 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Pabpc4lG5E8X2 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pabpc4lG5E8X2 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pabpc4lG5E8X2 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pabpc4lG5E8X2 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pabpc4lG5E8X2 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pabpc4lG5E8X2 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pabpc4lG5E8X2 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pabpc4lG5E8X2 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pabpc4lG5E8X2 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pabpc4lG5E8X2 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pabpc4lG5E8X2 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pabpc4lG5E8X2 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pabpc4lG5E8X2 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pabpc4lG5E8X2 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Pabpc4lG5E8X2 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pabpc4lG5E8X2 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pabpc4lG5E8X2 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pabpc4lG5E8X2 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pabpc4lG5E8X2 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Pabpc4lG5E8X2 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Pabpc4lG5E8X2 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pabpc4lG5E8X2 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pabpc4lG5E8X2 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pabpc4lG5E8X2 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pabpc4lG5E8X2 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pabpc4lG5E8X2 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pabpc4lG5E8X2 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pabpc4lG5E8X2 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Pabpc4lG5E8X2 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pabpc4lG5E8X2 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pabpc4lG5E8X2 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pabpc4lG5E8X2 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pabpc4lG5E8X2 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pabpc4lG5E8X2 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pabpc4lG5E8X2 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pabpc4lG5E8X2 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pabpc4lG5E8X2 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pabpc4lG5E8X2 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms