Protein–RNA interactions for Protein: G3X9R7

Rnf148, RING finger protein 148, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf148G3X9R7 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rnf148G3X9R7 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rnf148G3X9R7 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rnf148G3X9R7 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rnf148G3X9R7 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Rnf148G3X9R7 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Rnf148G3X9R7 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf148G3X9R7 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf148G3X9R7 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf148G3X9R7 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf148G3X9R7 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf148G3X9R7 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf148G3X9R7 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf148G3X9R7 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf148G3X9R7 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf148G3X9R7 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf148G3X9R7 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf148G3X9R7 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf148G3X9R7 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf148G3X9R7 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf148G3X9R7 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf148G3X9R7 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf148G3X9R7 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf148G3X9R7 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf148G3X9R7 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf148G3X9R7 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf148G3X9R7 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf148G3X9R7 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf148G3X9R7 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf148G3X9R7 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf148G3X9R7 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf148G3X9R7 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf148G3X9R7 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf148G3X9R7 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf148G3X9R7 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf148G3X9R7 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf148G3X9R7 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf148G3X9R7 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf148G3X9R7 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf148G3X9R7 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf148G3X9R7 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf148G3X9R7 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf148G3X9R7 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf148G3X9R7 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf148G3X9R7 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf148G3X9R7 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf148G3X9R7 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf148G3X9R7 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf148G3X9R7 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf148G3X9R7 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf148G3X9R7 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf148G3X9R7 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf148G3X9R7 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf148G3X9R7 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf148G3X9R7 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf148G3X9R7 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf148G3X9R7 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf148G3X9R7 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf148G3X9R7 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf148G3X9R7 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf148G3X9R7 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf148G3X9R7 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf148G3X9R7 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf148G3X9R7 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf148G3X9R7 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf148G3X9R7 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf148G3X9R7 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf148G3X9R7 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf148G3X9R7 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf148G3X9R7 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf148G3X9R7 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf148G3X9R7 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf148G3X9R7 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf148G3X9R7 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf148G3X9R7 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf148G3X9R7 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf148G3X9R7 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf148G3X9R7 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf148G3X9R7 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf148G3X9R7 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf148G3X9R7 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf148G3X9R7 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf148G3X9R7 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf148G3X9R7 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf148G3X9R7 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf148G3X9R7 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf148G3X9R7 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf148G3X9R7 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf148G3X9R7 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf148G3X9R7 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf148G3X9R7 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf148G3X9R7 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf148G3X9R7 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf148G3X9R7 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf148G3X9R7 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf148G3X9R7 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf148G3X9R7 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf148G3X9R7 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf148G3X9R7 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf148G3X9R7 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms