Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU2

Farp1, FERM, ARHGEF and pleckstrin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Farp1F8VPU2 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Farp1F8VPU2 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Farp1F8VPU2 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Farp1F8VPU2 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Farp1F8VPU2 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Farp1F8VPU2 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Farp1F8VPU2 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Farp1F8VPU2 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Farp1F8VPU2 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Farp1F8VPU2 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Farp1F8VPU2 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Farp1F8VPU2 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Farp1F8VPU2 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Farp1F8VPU2 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Farp1F8VPU2 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Farp1F8VPU2 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Farp1F8VPU2 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Farp1F8VPU2 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Farp1F8VPU2 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Farp1F8VPU2 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Farp1F8VPU2 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Farp1F8VPU2 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Farp1F8VPU2 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Farp1F8VPU2 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Farp1F8VPU2 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Farp1F8VPU2 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Farp1F8VPU2 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Farp1F8VPU2 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Farp1F8VPU2 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Farp1F8VPU2 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Farp1F8VPU2 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Farp1F8VPU2 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Farp1F8VPU2 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Farp1F8VPU2 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Farp1F8VPU2 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Farp1F8VPU2 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Farp1F8VPU2 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Farp1F8VPU2 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Farp1F8VPU2 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Farp1F8VPU2 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Farp1F8VPU2 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Farp1F8VPU2 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Farp1F8VPU2 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Farp1F8VPU2 Gm21156-201ENSMUST00000189693 869 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Farp1F8VPU2 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Farp1F8VPU2 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Farp1F8VPU2 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Farp1F8VPU2 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Farp1F8VPU2 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Farp1F8VPU2 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Farp1F8VPU2 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Farp1F8VPU2 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Farp1F8VPU2 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Farp1F8VPU2 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Farp1F8VPU2 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Farp1F8VPU2 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Farp1F8VPU2 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Farp1F8VPU2 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Farp1F8VPU2 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Farp1F8VPU2 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Farp1F8VPU2 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Farp1F8VPU2 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Farp1F8VPU2 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Farp1F8VPU2 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Farp1F8VPU2 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Farp1F8VPU2 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Farp1F8VPU2 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Farp1F8VPU2 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Farp1F8VPU2 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Farp1F8VPU2 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Farp1F8VPU2 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Farp1F8VPU2 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Farp1F8VPU2 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Farp1F8VPU2 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Farp1F8VPU2 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Farp1F8VPU2 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Farp1F8VPU2 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Farp1F8VPU2 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Farp1F8VPU2 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Farp1F8VPU2 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Farp1F8VPU2 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Farp1F8VPU2 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Farp1F8VPU2 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Farp1F8VPU2 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Farp1F8VPU2 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Farp1F8VPU2 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Farp1F8VPU2 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Farp1F8VPU2 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Farp1F8VPU2 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Farp1F8VPU2 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Farp1F8VPU2 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Farp1F8VPU2 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Farp1F8VPU2 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Farp1F8VPU2 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Farp1F8VPU2 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Farp1F8VPU2 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Farp1F8VPU2 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Farp1F8VPU2 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Farp1F8VPU2 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Farp1F8VPU2 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms