Protein–RNA interactions for Protein: F7BE40

Arl9, ADP-ribosylation factor-like 9 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 171 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arl9F7BE40 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Arl9F7BE40 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Arl9F7BE40 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Arl9F7BE40 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Arl9F7BE40 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Arl9F7BE40 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Arl9F7BE40 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Arl9F7BE40 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Arl9F7BE40 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Arl9F7BE40 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Arl9F7BE40 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Arl9F7BE40 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Arl9F7BE40 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Arl9F7BE40 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Arl9F7BE40 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Arl9F7BE40 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Arl9F7BE40 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Arl9F7BE40 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Arl9F7BE40 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Arl9F7BE40 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Arl9F7BE40 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Arl9F7BE40 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Arl9F7BE40 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Arl9F7BE40 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Arl9F7BE40 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Arl9F7BE40 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Arl9F7BE40 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Arl9F7BE40 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Arl9F7BE40 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Arl9F7BE40 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Arl9F7BE40 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Arl9F7BE40 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Arl9F7BE40 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Arl9F7BE40 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Arl9F7BE40 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Arl9F7BE40 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Arl9F7BE40 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Arl9F7BE40 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Arl9F7BE40 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Arl9F7BE40 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Arl9F7BE40 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Arl9F7BE40 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Arl9F7BE40 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Arl9F7BE40 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Arl9F7BE40 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Arl9F7BE40 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Arl9F7BE40 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Arl9F7BE40 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Arl9F7BE40 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Arl9F7BE40 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Arl9F7BE40 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Arl9F7BE40 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Arl9F7BE40 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Arl9F7BE40 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Arl9F7BE40 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Arl9F7BE40 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Arl9F7BE40 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Arl9F7BE40 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Arl9F7BE40 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Arl9F7BE40 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Arl9F7BE40 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Arl9F7BE40 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Arl9F7BE40 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Arl9F7BE40 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Arl9F7BE40 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Arl9F7BE40 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Arl9F7BE40 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Arl9F7BE40 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Arl9F7BE40 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Arl9F7BE40 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Arl9F7BE40 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Arl9F7BE40 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Arl9F7BE40 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Arl9F7BE40 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Arl9F7BE40 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Arl9F7BE40 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Arl9F7BE40 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Arl9F7BE40 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Arl9F7BE40 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Arl9F7BE40 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Arl9F7BE40 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Arl9F7BE40 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Arl9F7BE40 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Arl9F7BE40 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Arl9F7BE40 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Arl9F7BE40 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Arl9F7BE40 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Arl9F7BE40 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Arl9F7BE40 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Arl9F7BE40 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Arl9F7BE40 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Arl9F7BE40 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Arl9F7BE40 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Arl9F7BE40 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Arl9F7BE40 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Arl9F7BE40 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Arl9F7BE40 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Arl9F7BE40 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Arl9F7BE40 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Arl9F7BE40 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms