Protein–RNA interactions for Protein: F6XQQ1

Gm10378, Predicted gene 10378 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10378F6XQQ1 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
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Gm10378F6XQQ1 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm10378F6XQQ1 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm10378F6XQQ1 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gm10378F6XQQ1 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gm10378F6XQQ1 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gm10378F6XQQ1 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gm10378F6XQQ1 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm10378F6XQQ1 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm10378F6XQQ1 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm10378F6XQQ1 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm10378F6XQQ1 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm10378F6XQQ1 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm10378F6XQQ1 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm10378F6XQQ1 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm10378F6XQQ1 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm10378F6XQQ1 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm10378F6XQQ1 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm10378F6XQQ1 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm10378F6XQQ1 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm10378F6XQQ1 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm10378F6XQQ1 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm10378F6XQQ1 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm10378F6XQQ1 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm10378F6XQQ1 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm10378F6XQQ1 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm10378F6XQQ1 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm10378F6XQQ1 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
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Gm10378F6XQQ1 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm10378F6XQQ1 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm10378F6XQQ1 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm10378F6XQQ1 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm10378F6XQQ1 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
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Gm10378F6XQQ1 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm10378F6XQQ1 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm10378F6XQQ1 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm10378F6XQQ1 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
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Gm10378F6XQQ1 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm10378F6XQQ1 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
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Gm10378F6XQQ1 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm10378F6XQQ1 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm10378F6XQQ1 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm10378F6XQQ1 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm10378F6XQQ1 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm10378F6XQQ1 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm10378F6XQQ1 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm10378F6XQQ1 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm10378F6XQQ1 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm10378F6XQQ1 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm10378F6XQQ1 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm10378F6XQQ1 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm10378F6XQQ1 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm10378F6XQQ1 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm10378F6XQQ1 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
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Gm10378F6XQQ1 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
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Gm10378F6XQQ1 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
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Gm10378F6XQQ1 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm10378F6XQQ1 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm10378F6XQQ1 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm10378F6XQQ1 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm10378F6XQQ1 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm10378F6XQQ1 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm10378F6XQQ1 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm10378F6XQQ1 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm10378F6XQQ1 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm10378F6XQQ1 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm10378F6XQQ1 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm10378F6XQQ1 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm10378F6XQQ1 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm10378F6XQQ1 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm10378F6XQQ1 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm10378F6XQQ1 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm10378F6XQQ1 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm10378F6XQQ1 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm10378F6XQQ1 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm10378F6XQQ1 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm10378F6XQQ1 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm10378F6XQQ1 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm10378F6XQQ1 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm10378F6XQQ1 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm10378F6XQQ1 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm10378F6XQQ1 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm10378F6XQQ1 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm10378F6XQQ1 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm10378F6XQQ1 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
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