Protein–RNA interactions for Protein: F6SEU4

Syngap1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngap1F6SEU4 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Syngap1F6SEU4 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Syngap1F6SEU4 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Syngap1F6SEU4 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Syngap1F6SEU4 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Syngap1F6SEU4 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Syngap1F6SEU4 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Syngap1F6SEU4 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Syngap1F6SEU4 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Syngap1F6SEU4 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Syngap1F6SEU4 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Syngap1F6SEU4 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Syngap1F6SEU4 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Syngap1F6SEU4 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Syngap1F6SEU4 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Syngap1F6SEU4 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Syngap1F6SEU4 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Syngap1F6SEU4 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Syngap1F6SEU4 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Syngap1F6SEU4 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Syngap1F6SEU4 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Syngap1F6SEU4 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Syngap1F6SEU4 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Syngap1F6SEU4 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Syngap1F6SEU4 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Syngap1F6SEU4 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Syngap1F6SEU4 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Syngap1F6SEU4 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Syngap1F6SEU4 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Syngap1F6SEU4 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Syngap1F6SEU4 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Syngap1F6SEU4 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Syngap1F6SEU4 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Syngap1F6SEU4 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Syngap1F6SEU4 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Syngap1F6SEU4 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Syngap1F6SEU4 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Syngap1F6SEU4 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Syngap1F6SEU4 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Syngap1F6SEU4 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Syngap1F6SEU4 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Syngap1F6SEU4 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Syngap1F6SEU4 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Syngap1F6SEU4 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Syngap1F6SEU4 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Syngap1F6SEU4 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Syngap1F6SEU4 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Syngap1F6SEU4 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Syngap1F6SEU4 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Syngap1F6SEU4 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Syngap1F6SEU4 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Syngap1F6SEU4 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Syngap1F6SEU4 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Syngap1F6SEU4 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Syngap1F6SEU4 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Syngap1F6SEU4 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Syngap1F6SEU4 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Syngap1F6SEU4 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Syngap1F6SEU4 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Syngap1F6SEU4 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Syngap1F6SEU4 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Syngap1F6SEU4 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Syngap1F6SEU4 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Syngap1F6SEU4 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Syngap1F6SEU4 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Syngap1F6SEU4 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Syngap1F6SEU4 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Syngap1F6SEU4 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Syngap1F6SEU4 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Syngap1F6SEU4 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Syngap1F6SEU4 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Syngap1F6SEU4 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Syngap1F6SEU4 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Syngap1F6SEU4 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Syngap1F6SEU4 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Syngap1F6SEU4 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Syngap1F6SEU4 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Syngap1F6SEU4 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Syngap1F6SEU4 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Syngap1F6SEU4 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Syngap1F6SEU4 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Syngap1F6SEU4 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Syngap1F6SEU4 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Syngap1F6SEU4 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Syngap1F6SEU4 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Syngap1F6SEU4 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Syngap1F6SEU4 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Syngap1F6SEU4 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Syngap1F6SEU4 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Syngap1F6SEU4 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Syngap1F6SEU4 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Syngap1F6SEU4 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Syngap1F6SEU4 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Syngap1F6SEU4 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Syngap1F6SEU4 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Syngap1F6SEU4 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Syngap1F6SEU4 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Syngap1F6SEU4 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Syngap1F6SEU4 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Syngap1F6SEU4 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms