Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7Q1

Gm5407, Predicted gene 5407, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5407E9Q7Q1 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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Gm5407E9Q7Q1 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5407E9Q7Q1 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5407E9Q7Q1 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5407E9Q7Q1 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5407E9Q7Q1 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5407E9Q7Q1 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5407E9Q7Q1 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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Gm5407E9Q7Q1 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5407E9Q7Q1 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5407E9Q7Q1 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Gm5407E9Q7Q1 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Gm5407E9Q7Q1 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5407E9Q7Q1 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Gm5407E9Q7Q1 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5407E9Q7Q1 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5407E9Q7Q1 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Gm5407E9Q7Q1 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Gm5407E9Q7Q1 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5407E9Q7Q1 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5407E9Q7Q1 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5407E9Q7Q1 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5407E9Q7Q1 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5407E9Q7Q1 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5407E9Q7Q1 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Gm5407E9Q7Q1 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5407E9Q7Q1 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5407E9Q7Q1 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Gm5407E9Q7Q1 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5407E9Q7Q1 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Gm5407E9Q7Q1 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Gm5407E9Q7Q1 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5407E9Q7Q1 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5407E9Q7Q1 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5407E9Q7Q1 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Gm5407E9Q7Q1 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5407E9Q7Q1 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5407E9Q7Q1 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5407E9Q7Q1 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5407E9Q7Q1 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5407E9Q7Q1 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5407E9Q7Q1 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5407E9Q7Q1 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Gm5407E9Q7Q1 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
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Gm5407E9Q7Q1 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5407E9Q7Q1 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
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