Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6Y8

Usp31, Ubiquitin-specific peptidase 31, mousemouse

Predictions only

Length 1,344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp31E9Q6Y8 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Usp31E9Q6Y8 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Usp31E9Q6Y8 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Usp31E9Q6Y8 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Usp31E9Q6Y8 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Usp31E9Q6Y8 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Usp31E9Q6Y8 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Usp31E9Q6Y8 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Usp31E9Q6Y8 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Usp31E9Q6Y8 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Usp31E9Q6Y8 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Usp31E9Q6Y8 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Usp31E9Q6Y8 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Usp31E9Q6Y8 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Usp31E9Q6Y8 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Usp31E9Q6Y8 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Usp31E9Q6Y8 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Usp31E9Q6Y8 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Usp31E9Q6Y8 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Usp31E9Q6Y8 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Usp31E9Q6Y8 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Usp31E9Q6Y8 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Usp31E9Q6Y8 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Usp31E9Q6Y8 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Usp31E9Q6Y8 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Usp31E9Q6Y8 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Usp31E9Q6Y8 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Usp31E9Q6Y8 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Usp31E9Q6Y8 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Usp31E9Q6Y8 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Usp31E9Q6Y8 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Usp31E9Q6Y8 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Usp31E9Q6Y8 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Usp31E9Q6Y8 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Usp31E9Q6Y8 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Usp31E9Q6Y8 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Usp31E9Q6Y8 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Usp31E9Q6Y8 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Usp31E9Q6Y8 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Usp31E9Q6Y8 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Usp31E9Q6Y8 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Usp31E9Q6Y8 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Usp31E9Q6Y8 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Usp31E9Q6Y8 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Usp31E9Q6Y8 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Usp31E9Q6Y8 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Usp31E9Q6Y8 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Usp31E9Q6Y8 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Usp31E9Q6Y8 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Usp31E9Q6Y8 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Usp31E9Q6Y8 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Usp31E9Q6Y8 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Usp31E9Q6Y8 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Usp31E9Q6Y8 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Usp31E9Q6Y8 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Usp31E9Q6Y8 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Usp31E9Q6Y8 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Usp31E9Q6Y8 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Usp31E9Q6Y8 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Usp31E9Q6Y8 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Usp31E9Q6Y8 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Usp31E9Q6Y8 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Usp31E9Q6Y8 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Usp31E9Q6Y8 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Usp31E9Q6Y8 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Usp31E9Q6Y8 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Usp31E9Q6Y8 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Usp31E9Q6Y8 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Usp31E9Q6Y8 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Usp31E9Q6Y8 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Usp31E9Q6Y8 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Usp31E9Q6Y8 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Usp31E9Q6Y8 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Usp31E9Q6Y8 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Usp31E9Q6Y8 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Usp31E9Q6Y8 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Usp31E9Q6Y8 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Usp31E9Q6Y8 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Usp31E9Q6Y8 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Usp31E9Q6Y8 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Usp31E9Q6Y8 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Usp31E9Q6Y8 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Usp31E9Q6Y8 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Usp31E9Q6Y8 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Usp31E9Q6Y8 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Usp31E9Q6Y8 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Usp31E9Q6Y8 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Usp31E9Q6Y8 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Usp31E9Q6Y8 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Usp31E9Q6Y8 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Usp31E9Q6Y8 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Usp31E9Q6Y8 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Usp31E9Q6Y8 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Usp31E9Q6Y8 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Usp31E9Q6Y8 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Usp31E9Q6Y8 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Usp31E9Q6Y8 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Usp31E9Q6Y8 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Usp31E9Q6Y8 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Usp31E9Q6Y8 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms