Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6W0

BC030500, cDNA sequence BC030500 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC030500E9Q6W0 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
BC030500E9Q6W0 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
BC030500E9Q6W0 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
BC030500E9Q6W0 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
BC030500E9Q6W0 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
BC030500E9Q6W0 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
BC030500E9Q6W0 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
BC030500E9Q6W0 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
BC030500E9Q6W0 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
BC030500E9Q6W0 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
BC030500E9Q6W0 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
BC030500E9Q6W0 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
BC030500E9Q6W0 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
BC030500E9Q6W0 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
BC030500E9Q6W0 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
BC030500E9Q6W0 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
BC030500E9Q6W0 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
BC030500E9Q6W0 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
BC030500E9Q6W0 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
BC030500E9Q6W0 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
BC030500E9Q6W0 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
BC030500E9Q6W0 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
BC030500E9Q6W0 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
BC030500E9Q6W0 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
BC030500E9Q6W0 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
BC030500E9Q6W0 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
BC030500E9Q6W0 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
BC030500E9Q6W0 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.3
BC030500E9Q6W0 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
BC030500E9Q6W0 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
BC030500E9Q6W0 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
BC030500E9Q6W0 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
BC030500E9Q6W0 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
BC030500E9Q6W0 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
BC030500E9Q6W0 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
BC030500E9Q6W0 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
BC030500E9Q6W0 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
BC030500E9Q6W0 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
BC030500E9Q6W0 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
BC030500E9Q6W0 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
BC030500E9Q6W0 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
BC030500E9Q6W0 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
BC030500E9Q6W0 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
BC030500E9Q6W0 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
BC030500E9Q6W0 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
BC030500E9Q6W0 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
BC030500E9Q6W0 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
BC030500E9Q6W0 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
BC030500E9Q6W0 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
BC030500E9Q6W0 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
BC030500E9Q6W0 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
BC030500E9Q6W0 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
BC030500E9Q6W0 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
BC030500E9Q6W0 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
BC030500E9Q6W0 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
BC030500E9Q6W0 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
BC030500E9Q6W0 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
BC030500E9Q6W0 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
BC030500E9Q6W0 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
BC030500E9Q6W0 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
BC030500E9Q6W0 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
BC030500E9Q6W0 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
BC030500E9Q6W0 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
BC030500E9Q6W0 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
BC030500E9Q6W0 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
BC030500E9Q6W0 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
BC030500E9Q6W0 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
BC030500E9Q6W0 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
BC030500E9Q6W0 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
BC030500E9Q6W0 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
BC030500E9Q6W0 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
BC030500E9Q6W0 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
BC030500E9Q6W0 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
BC030500E9Q6W0 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
BC030500E9Q6W0 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
BC030500E9Q6W0 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
BC030500E9Q6W0 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
BC030500E9Q6W0 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
BC030500E9Q6W0 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
BC030500E9Q6W0 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
BC030500E9Q6W0 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
BC030500E9Q6W0 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
BC030500E9Q6W0 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
BC030500E9Q6W0 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
BC030500E9Q6W0 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
BC030500E9Q6W0 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
BC030500E9Q6W0 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
BC030500E9Q6W0 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
BC030500E9Q6W0 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
BC030500E9Q6W0 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
BC030500E9Q6W0 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
BC030500E9Q6W0 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
BC030500E9Q6W0 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
BC030500E9Q6W0 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
BC030500E9Q6W0 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
BC030500E9Q6W0 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
BC030500E9Q6W0 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
BC030500E9Q6W0 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
BC030500E9Q6W0 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
BC030500E9Q6W0 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms