Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6I0

Vmn2r116, Vomeronasal type-2 receptor 116, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r116E9Q6I0 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn2r116E9Q6I0 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn2r116E9Q6I0 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn2r116E9Q6I0 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn2r116E9Q6I0 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn2r116E9Q6I0 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn2r116E9Q6I0 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn2r116E9Q6I0 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn2r116E9Q6I0 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn2r116E9Q6I0 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn2r116E9Q6I0 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn2r116E9Q6I0 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn2r116E9Q6I0 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn2r116E9Q6I0 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn2r116E9Q6I0 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn2r116E9Q6I0 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn2r116E9Q6I0 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn2r116E9Q6I0 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn2r116E9Q6I0 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn2r116E9Q6I0 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn2r116E9Q6I0 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn2r116E9Q6I0 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn2r116E9Q6I0 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn2r116E9Q6I0 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn2r116E9Q6I0 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn2r116E9Q6I0 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn2r116E9Q6I0 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn2r116E9Q6I0 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn2r116E9Q6I0 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn2r116E9Q6I0 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn2r116E9Q6I0 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn2r116E9Q6I0 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn2r116E9Q6I0 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn2r116E9Q6I0 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn2r116E9Q6I0 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn2r116E9Q6I0 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn2r116E9Q6I0 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn2r116E9Q6I0 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn2r116E9Q6I0 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn2r116E9Q6I0 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn2r116E9Q6I0 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn2r116E9Q6I0 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn2r116E9Q6I0 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn2r116E9Q6I0 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn2r116E9Q6I0 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn2r116E9Q6I0 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn2r116E9Q6I0 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn2r116E9Q6I0 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn2r116E9Q6I0 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn2r116E9Q6I0 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn2r116E9Q6I0 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Vmn2r116E9Q6I0 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Vmn2r116E9Q6I0 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn2r116E9Q6I0 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn2r116E9Q6I0 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn2r116E9Q6I0 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn2r116E9Q6I0 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn2r116E9Q6I0 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn2r116E9Q6I0 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn2r116E9Q6I0 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn2r116E9Q6I0 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn2r116E9Q6I0 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn2r116E9Q6I0 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn2r116E9Q6I0 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn2r116E9Q6I0 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn2r116E9Q6I0 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn2r116E9Q6I0 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn2r116E9Q6I0 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn2r116E9Q6I0 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn2r116E9Q6I0 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn2r116E9Q6I0 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn2r116E9Q6I0 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn2r116E9Q6I0 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn2r116E9Q6I0 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn2r116E9Q6I0 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn2r116E9Q6I0 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn2r116E9Q6I0 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn2r116E9Q6I0 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn2r116E9Q6I0 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn2r116E9Q6I0 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn2r116E9Q6I0 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn2r116E9Q6I0 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn2r116E9Q6I0 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn2r116E9Q6I0 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn2r116E9Q6I0 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn2r116E9Q6I0 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn2r116E9Q6I0 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn2r116E9Q6I0 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn2r116E9Q6I0 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn2r116E9Q6I0 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn2r116E9Q6I0 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn2r116E9Q6I0 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn2r116E9Q6I0 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn2r116E9Q6I0 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn2r116E9Q6I0 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn2r116E9Q6I0 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn2r116E9Q6I0 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn2r116E9Q6I0 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn2r116E9Q6I0 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn2r116E9Q6I0 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms