Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5Z5

Fancf, Fanconi anemia group F protein, mousemouse

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Length 343 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FancfE9Q5Z5 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FancfE9Q5Z5 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
FancfE9Q5Z5 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FancfE9Q5Z5 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FancfE9Q5Z5 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FancfE9Q5Z5 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FancfE9Q5Z5 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FancfE9Q5Z5 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FancfE9Q5Z5 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FancfE9Q5Z5 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
FancfE9Q5Z5 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FancfE9Q5Z5 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FancfE9Q5Z5 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FancfE9Q5Z5 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FancfE9Q5Z5 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FancfE9Q5Z5 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FancfE9Q5Z5 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
FancfE9Q5Z5 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
FancfE9Q5Z5 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FancfE9Q5Z5 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FancfE9Q5Z5 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FancfE9Q5Z5 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FancfE9Q5Z5 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FancfE9Q5Z5 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
FancfE9Q5Z5 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FancfE9Q5Z5 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FancfE9Q5Z5 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FancfE9Q5Z5 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FancfE9Q5Z5 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FancfE9Q5Z5 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FancfE9Q5Z5 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FancfE9Q5Z5 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FancfE9Q5Z5 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FancfE9Q5Z5 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FancfE9Q5Z5 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FancfE9Q5Z5 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FancfE9Q5Z5 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FancfE9Q5Z5 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FancfE9Q5Z5 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FancfE9Q5Z5 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FancfE9Q5Z5 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FancfE9Q5Z5 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FancfE9Q5Z5 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FancfE9Q5Z5 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FancfE9Q5Z5 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FancfE9Q5Z5 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FancfE9Q5Z5 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FancfE9Q5Z5 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FancfE9Q5Z5 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FancfE9Q5Z5 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FancfE9Q5Z5 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
FancfE9Q5Z5 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FancfE9Q5Z5 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FancfE9Q5Z5 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FancfE9Q5Z5 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FancfE9Q5Z5 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FancfE9Q5Z5 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FancfE9Q5Z5 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FancfE9Q5Z5 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FancfE9Q5Z5 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FancfE9Q5Z5 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FancfE9Q5Z5 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FancfE9Q5Z5 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FancfE9Q5Z5 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FancfE9Q5Z5 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FancfE9Q5Z5 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FancfE9Q5Z5 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FancfE9Q5Z5 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FancfE9Q5Z5 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FancfE9Q5Z5 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FancfE9Q5Z5 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
FancfE9Q5Z5 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FancfE9Q5Z5 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
FancfE9Q5Z5 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FancfE9Q5Z5 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FancfE9Q5Z5 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
FancfE9Q5Z5 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FancfE9Q5Z5 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FancfE9Q5Z5 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FancfE9Q5Z5 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FancfE9Q5Z5 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FancfE9Q5Z5 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FancfE9Q5Z5 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FancfE9Q5Z5 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FancfE9Q5Z5 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FancfE9Q5Z5 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FancfE9Q5Z5 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FancfE9Q5Z5 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FancfE9Q5Z5 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FancfE9Q5Z5 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FancfE9Q5Z5 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FancfE9Q5Z5 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
FancfE9Q5Z5 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FancfE9Q5Z5 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FancfE9Q5Z5 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FancfE9Q5Z5 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FancfE9Q5Z5 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FancfE9Q5Z5 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
FancfE9Q5Z5 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
FancfE9Q5Z5 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms