Protein–RNA interactions for Protein: E9Q492

Pgbd1, PiggyBac transposable element-derived 1, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pgbd1E9Q492 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Pgbd1E9Q492 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pgbd1E9Q492 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pgbd1E9Q492 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pgbd1E9Q492 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pgbd1E9Q492 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pgbd1E9Q492 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pgbd1E9Q492 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pgbd1E9Q492 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pgbd1E9Q492 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pgbd1E9Q492 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pgbd1E9Q492 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pgbd1E9Q492 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pgbd1E9Q492 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Pgbd1E9Q492 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pgbd1E9Q492 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pgbd1E9Q492 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pgbd1E9Q492 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pgbd1E9Q492 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pgbd1E9Q492 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pgbd1E9Q492 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pgbd1E9Q492 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pgbd1E9Q492 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pgbd1E9Q492 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pgbd1E9Q492 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pgbd1E9Q492 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pgbd1E9Q492 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pgbd1E9Q492 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pgbd1E9Q492 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pgbd1E9Q492 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pgbd1E9Q492 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pgbd1E9Q492 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pgbd1E9Q492 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pgbd1E9Q492 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pgbd1E9Q492 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pgbd1E9Q492 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pgbd1E9Q492 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pgbd1E9Q492 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pgbd1E9Q492 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pgbd1E9Q492 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pgbd1E9Q492 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pgbd1E9Q492 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pgbd1E9Q492 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pgbd1E9Q492 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pgbd1E9Q492 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pgbd1E9Q492 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pgbd1E9Q492 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pgbd1E9Q492 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Pgbd1E9Q492 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pgbd1E9Q492 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pgbd1E9Q492 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pgbd1E9Q492 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pgbd1E9Q492 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pgbd1E9Q492 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pgbd1E9Q492 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pgbd1E9Q492 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pgbd1E9Q492 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pgbd1E9Q492 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pgbd1E9Q492 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pgbd1E9Q492 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pgbd1E9Q492 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pgbd1E9Q492 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pgbd1E9Q492 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pgbd1E9Q492 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Pgbd1E9Q492 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pgbd1E9Q492 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pgbd1E9Q492 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pgbd1E9Q492 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pgbd1E9Q492 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pgbd1E9Q492 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pgbd1E9Q492 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pgbd1E9Q492 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pgbd1E9Q492 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pgbd1E9Q492 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pgbd1E9Q492 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Pgbd1E9Q492 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pgbd1E9Q492 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pgbd1E9Q492 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pgbd1E9Q492 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pgbd1E9Q492 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pgbd1E9Q492 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pgbd1E9Q492 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pgbd1E9Q492 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pgbd1E9Q492 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pgbd1E9Q492 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pgbd1E9Q492 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pgbd1E9Q492 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pgbd1E9Q492 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pgbd1E9Q492 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pgbd1E9Q492 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pgbd1E9Q492 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pgbd1E9Q492 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pgbd1E9Q492 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pgbd1E9Q492 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Pgbd1E9Q492 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pgbd1E9Q492 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pgbd1E9Q492 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pgbd1E9Q492 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pgbd1E9Q492 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pgbd1E9Q492 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.4 ms