Protein–RNA interactions for Protein: E9Q414

Apob, Apolipoprotein B-100, mousemouse

Predictions only

Length 4,505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobE9Q414 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
ApobE9Q414 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
ApobE9Q414 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
ApobE9Q414 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
ApobE9Q414 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
ApobE9Q414 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
ApobE9Q414 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
ApobE9Q414 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
ApobE9Q414 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
ApobE9Q414 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
ApobE9Q414 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
ApobE9Q414 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
ApobE9Q414 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
ApobE9Q414 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
ApobE9Q414 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
ApobE9Q414 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
ApobE9Q414 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
ApobE9Q414 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
ApobE9Q414 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
ApobE9Q414 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
ApobE9Q414 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
ApobE9Q414 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
ApobE9Q414 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
ApobE9Q414 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
ApobE9Q414 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
ApobE9Q414 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
ApobE9Q414 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
ApobE9Q414 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
ApobE9Q414 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
ApobE9Q414 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
ApobE9Q414 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
ApobE9Q414 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
ApobE9Q414 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
ApobE9Q414 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
ApobE9Q414 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
ApobE9Q414 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
ApobE9Q414 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
ApobE9Q414 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
ApobE9Q414 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
ApobE9Q414 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
ApobE9Q414 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
ApobE9Q414 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
ApobE9Q414 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
ApobE9Q414 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
ApobE9Q414 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
ApobE9Q414 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
ApobE9Q414 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
ApobE9Q414 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.79
ApobE9Q414 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
ApobE9Q414 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
ApobE9Q414 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
ApobE9Q414 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
ApobE9Q414 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
ApobE9Q414 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
ApobE9Q414 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
ApobE9Q414 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
ApobE9Q414 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
ApobE9Q414 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
ApobE9Q414 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
ApobE9Q414 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
ApobE9Q414 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
ApobE9Q414 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
ApobE9Q414 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
ApobE9Q414 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
ApobE9Q414 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
ApobE9Q414 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
ApobE9Q414 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
ApobE9Q414 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
ApobE9Q414 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
ApobE9Q414 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
ApobE9Q414 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
ApobE9Q414 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
ApobE9Q414 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
ApobE9Q414 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
ApobE9Q414 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
ApobE9Q414 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
ApobE9Q414 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
ApobE9Q414 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
ApobE9Q414 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
ApobE9Q414 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
ApobE9Q414 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
ApobE9Q414 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
ApobE9Q414 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
ApobE9Q414 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
ApobE9Q414 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
ApobE9Q414 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
ApobE9Q414 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
ApobE9Q414 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
ApobE9Q414 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
ApobE9Q414 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
ApobE9Q414 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
ApobE9Q414 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
ApobE9Q414 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
ApobE9Q414 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
ApobE9Q414 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
ApobE9Q414 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
ApobE9Q414 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
ApobE9Q414 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
ApobE9Q414 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
ApobE9Q414 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
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