Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0Q3

2610021A01Rik, RIKEN cDNA 2610021A01 gene, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2610021A01RikE9Q0Q3 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
2610021A01RikE9Q0Q3 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
2610021A01RikE9Q0Q3 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
2610021A01RikE9Q0Q3 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
2610021A01RikE9Q0Q3 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
2610021A01RikE9Q0Q3 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
2610021A01RikE9Q0Q3 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
2610021A01RikE9Q0Q3 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
2610021A01RikE9Q0Q3 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
2610021A01RikE9Q0Q3 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
2610021A01RikE9Q0Q3 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
2610021A01RikE9Q0Q3 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
2610021A01RikE9Q0Q3 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
2610021A01RikE9Q0Q3 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
2610021A01RikE9Q0Q3 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
2610021A01RikE9Q0Q3 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
2610021A01RikE9Q0Q3 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
2610021A01RikE9Q0Q3 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
2610021A01RikE9Q0Q3 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
2610021A01RikE9Q0Q3 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
2610021A01RikE9Q0Q3 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
2610021A01RikE9Q0Q3 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
2610021A01RikE9Q0Q3 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
2610021A01RikE9Q0Q3 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
2610021A01RikE9Q0Q3 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
2610021A01RikE9Q0Q3 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
2610021A01RikE9Q0Q3 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
2610021A01RikE9Q0Q3 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
2610021A01RikE9Q0Q3 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
2610021A01RikE9Q0Q3 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
2610021A01RikE9Q0Q3 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
2610021A01RikE9Q0Q3 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
2610021A01RikE9Q0Q3 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
2610021A01RikE9Q0Q3 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
2610021A01RikE9Q0Q3 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
2610021A01RikE9Q0Q3 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
2610021A01RikE9Q0Q3 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
2610021A01RikE9Q0Q3 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
2610021A01RikE9Q0Q3 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
2610021A01RikE9Q0Q3 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
2610021A01RikE9Q0Q3 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
2610021A01RikE9Q0Q3 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
2610021A01RikE9Q0Q3 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
2610021A01RikE9Q0Q3 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
2610021A01RikE9Q0Q3 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
2610021A01RikE9Q0Q3 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
2610021A01RikE9Q0Q3 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
2610021A01RikE9Q0Q3 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
2610021A01RikE9Q0Q3 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
2610021A01RikE9Q0Q3 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
2610021A01RikE9Q0Q3 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
2610021A01RikE9Q0Q3 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
2610021A01RikE9Q0Q3 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
2610021A01RikE9Q0Q3 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
2610021A01RikE9Q0Q3 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
2610021A01RikE9Q0Q3 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
2610021A01RikE9Q0Q3 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
2610021A01RikE9Q0Q3 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
2610021A01RikE9Q0Q3 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
2610021A01RikE9Q0Q3 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
2610021A01RikE9Q0Q3 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
2610021A01RikE9Q0Q3 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
2610021A01RikE9Q0Q3 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
2610021A01RikE9Q0Q3 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
2610021A01RikE9Q0Q3 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
2610021A01RikE9Q0Q3 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
2610021A01RikE9Q0Q3 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
2610021A01RikE9Q0Q3 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
2610021A01RikE9Q0Q3 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
2610021A01RikE9Q0Q3 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
2610021A01RikE9Q0Q3 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
2610021A01RikE9Q0Q3 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
2610021A01RikE9Q0Q3 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
2610021A01RikE9Q0Q3 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
2610021A01RikE9Q0Q3 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
2610021A01RikE9Q0Q3 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
2610021A01RikE9Q0Q3 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
2610021A01RikE9Q0Q3 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
2610021A01RikE9Q0Q3 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
2610021A01RikE9Q0Q3 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
2610021A01RikE9Q0Q3 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
2610021A01RikE9Q0Q3 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
2610021A01RikE9Q0Q3 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
2610021A01RikE9Q0Q3 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
2610021A01RikE9Q0Q3 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
2610021A01RikE9Q0Q3 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
2610021A01RikE9Q0Q3 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
2610021A01RikE9Q0Q3 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
2610021A01RikE9Q0Q3 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
2610021A01RikE9Q0Q3 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
2610021A01RikE9Q0Q3 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
2610021A01RikE9Q0Q3 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms