Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0B4

Cdr1, Cerebellar degeneration-related antigen 1, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdr1E9Q0B4 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdr1E9Q0B4 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdr1E9Q0B4 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cdr1E9Q0B4 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cdr1E9Q0B4 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cdr1E9Q0B4 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cdr1E9Q0B4 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cdr1E9Q0B4 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cdr1E9Q0B4 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cdr1E9Q0B4 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cdr1E9Q0B4 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cdr1E9Q0B4 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cdr1E9Q0B4 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cdr1E9Q0B4 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cdr1E9Q0B4 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cdr1E9Q0B4 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cdr1E9Q0B4 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cdr1E9Q0B4 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cdr1E9Q0B4 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cdr1E9Q0B4 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cdr1E9Q0B4 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cdr1E9Q0B4 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cdr1E9Q0B4 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cdr1E9Q0B4 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cdr1E9Q0B4 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cdr1E9Q0B4 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdr1E9Q0B4 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdr1E9Q0B4 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdr1E9Q0B4 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdr1E9Q0B4 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdr1E9Q0B4 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdr1E9Q0B4 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdr1E9Q0B4 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdr1E9Q0B4 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdr1E9Q0B4 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdr1E9Q0B4 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdr1E9Q0B4 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdr1E9Q0B4 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdr1E9Q0B4 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdr1E9Q0B4 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdr1E9Q0B4 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdr1E9Q0B4 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdr1E9Q0B4 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdr1E9Q0B4 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdr1E9Q0B4 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdr1E9Q0B4 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdr1E9Q0B4 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdr1E9Q0B4 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdr1E9Q0B4 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdr1E9Q0B4 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdr1E9Q0B4 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdr1E9Q0B4 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdr1E9Q0B4 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdr1E9Q0B4 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdr1E9Q0B4 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdr1E9Q0B4 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdr1E9Q0B4 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdr1E9Q0B4 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdr1E9Q0B4 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdr1E9Q0B4 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdr1E9Q0B4 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdr1E9Q0B4 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdr1E9Q0B4 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdr1E9Q0B4 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdr1E9Q0B4 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdr1E9Q0B4 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdr1E9Q0B4 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdr1E9Q0B4 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdr1E9Q0B4 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdr1E9Q0B4 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdr1E9Q0B4 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdr1E9Q0B4 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdr1E9Q0B4 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdr1E9Q0B4 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdr1E9Q0B4 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdr1E9Q0B4 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdr1E9Q0B4 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdr1E9Q0B4 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdr1E9Q0B4 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdr1E9Q0B4 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdr1E9Q0B4 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdr1E9Q0B4 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdr1E9Q0B4 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdr1E9Q0B4 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdr1E9Q0B4 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdr1E9Q0B4 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdr1E9Q0B4 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdr1E9Q0B4 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdr1E9Q0B4 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdr1E9Q0B4 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdr1E9Q0B4 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdr1E9Q0B4 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdr1E9Q0B4 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdr1E9Q0B4 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdr1E9Q0B4 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdr1E9Q0B4 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdr1E9Q0B4 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdr1E9Q0B4 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdr1E9Q0B4 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdr1E9Q0B4 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms