Protein–RNA interactions for Protein: E9Q058

Gm3095, Predicted gene 3095, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3095E9Q058 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm3095E9Q058 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm3095E9Q058 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm3095E9Q058 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm3095E9Q058 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm3095E9Q058 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm3095E9Q058 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm3095E9Q058 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm3095E9Q058 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm3095E9Q058 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm3095E9Q058 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm3095E9Q058 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm3095E9Q058 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm3095E9Q058 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm3095E9Q058 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm3095E9Q058 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm3095E9Q058 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm3095E9Q058 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm3095E9Q058 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm3095E9Q058 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm3095E9Q058 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm3095E9Q058 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm3095E9Q058 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm3095E9Q058 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm3095E9Q058 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm3095E9Q058 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm3095E9Q058 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm3095E9Q058 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm3095E9Q058 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm3095E9Q058 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm3095E9Q058 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm3095E9Q058 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm3095E9Q058 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm3095E9Q058 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm3095E9Q058 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm3095E9Q058 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm3095E9Q058 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm3095E9Q058 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm3095E9Q058 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm3095E9Q058 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm3095E9Q058 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm3095E9Q058 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm3095E9Q058 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm3095E9Q058 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm3095E9Q058 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm3095E9Q058 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm3095E9Q058 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm3095E9Q058 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm3095E9Q058 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm3095E9Q058 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm3095E9Q058 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm3095E9Q058 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm3095E9Q058 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm3095E9Q058 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm3095E9Q058 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm3095E9Q058 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm3095E9Q058 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm3095E9Q058 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm3095E9Q058 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm3095E9Q058 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm3095E9Q058 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm3095E9Q058 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm3095E9Q058 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm3095E9Q058 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm3095E9Q058 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm3095E9Q058 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm3095E9Q058 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm3095E9Q058 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm3095E9Q058 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm3095E9Q058 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm3095E9Q058 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm3095E9Q058 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm3095E9Q058 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm3095E9Q058 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm3095E9Q058 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm3095E9Q058 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm3095E9Q058 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Gm3095E9Q058 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Gm3095E9Q058 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Gm3095E9Q058 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Gm3095E9Q058 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm3095E9Q058 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm3095E9Q058 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm3095E9Q058 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm3095E9Q058 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm3095E9Q058 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm3095E9Q058 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm3095E9Q058 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm3095E9Q058 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm3095E9Q058 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm3095E9Q058 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm3095E9Q058 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm3095E9Q058 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm3095E9Q058 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm3095E9Q058 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm3095E9Q058 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm3095E9Q058 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm3095E9Q058 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm3095E9Q058 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm3095E9Q058 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms