Protein–RNA interactions for Protein: E9PXF3

Gm5415, Predicted gene 5415, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5415E9PXF3 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm5415E9PXF3 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm5415E9PXF3 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm5415E9PXF3 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm5415E9PXF3 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm5415E9PXF3 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm5415E9PXF3 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm5415E9PXF3 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm5415E9PXF3 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm5415E9PXF3 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm5415E9PXF3 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm5415E9PXF3 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm5415E9PXF3 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm5415E9PXF3 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm5415E9PXF3 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm5415E9PXF3 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm5415E9PXF3 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm5415E9PXF3 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm5415E9PXF3 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm5415E9PXF3 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm5415E9PXF3 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm5415E9PXF3 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm5415E9PXF3 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm5415E9PXF3 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm5415E9PXF3 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm5415E9PXF3 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm5415E9PXF3 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm5415E9PXF3 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm5415E9PXF3 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm5415E9PXF3 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm5415E9PXF3 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm5415E9PXF3 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm5415E9PXF3 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm5415E9PXF3 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm5415E9PXF3 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm5415E9PXF3 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm5415E9PXF3 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm5415E9PXF3 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm5415E9PXF3 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm5415E9PXF3 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm5415E9PXF3 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm5415E9PXF3 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm5415E9PXF3 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm5415E9PXF3 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm5415E9PXF3 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gm5415E9PXF3 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gm5415E9PXF3 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gm5415E9PXF3 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gm5415E9PXF3 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gm5415E9PXF3 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gm5415E9PXF3 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gm5415E9PXF3 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gm5415E9PXF3 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gm5415E9PXF3 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gm5415E9PXF3 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm5415E9PXF3 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm5415E9PXF3 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm5415E9PXF3 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm5415E9PXF3 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm5415E9PXF3 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm5415E9PXF3 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm5415E9PXF3 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm5415E9PXF3 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm5415E9PXF3 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm5415E9PXF3 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm5415E9PXF3 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm5415E9PXF3 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm5415E9PXF3 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm5415E9PXF3 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm5415E9PXF3 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm5415E9PXF3 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm5415E9PXF3 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm5415E9PXF3 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm5415E9PXF3 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm5415E9PXF3 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm5415E9PXF3 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm5415E9PXF3 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm5415E9PXF3 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm5415E9PXF3 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm5415E9PXF3 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm5415E9PXF3 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm5415E9PXF3 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm5415E9PXF3 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm5415E9PXF3 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm5415E9PXF3 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm5415E9PXF3 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm5415E9PXF3 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm5415E9PXF3 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm5415E9PXF3 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm5415E9PXF3 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm5415E9PXF3 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm5415E9PXF3 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm5415E9PXF3 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm5415E9PXF3 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm5415E9PXF3 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm5415E9PXF3 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm5415E9PXF3 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm5415E9PXF3 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm5415E9PXF3 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm5415E9PXF3 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms