Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB5

Ttc17, Tetratricopeptide repeat protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 1,198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc17E9PVB5 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ttc17E9PVB5 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ttc17E9PVB5 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ttc17E9PVB5 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ttc17E9PVB5 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ttc17E9PVB5 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Ttc17E9PVB5 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Ttc17E9PVB5 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ttc17E9PVB5 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ttc17E9PVB5 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ttc17E9PVB5 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ttc17E9PVB5 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ttc17E9PVB5 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ttc17E9PVB5 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ttc17E9PVB5 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ttc17E9PVB5 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ttc17E9PVB5 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ttc17E9PVB5 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ttc17E9PVB5 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ttc17E9PVB5 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ttc17E9PVB5 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ttc17E9PVB5 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ttc17E9PVB5 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ttc17E9PVB5 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ttc17E9PVB5 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ttc17E9PVB5 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ttc17E9PVB5 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ttc17E9PVB5 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ttc17E9PVB5 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ttc17E9PVB5 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ttc17E9PVB5 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ttc17E9PVB5 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ttc17E9PVB5 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ttc17E9PVB5 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ttc17E9PVB5 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ttc17E9PVB5 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ttc17E9PVB5 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ttc17E9PVB5 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ttc17E9PVB5 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ttc17E9PVB5 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ttc17E9PVB5 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ttc17E9PVB5 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ttc17E9PVB5 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ttc17E9PVB5 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Ttc17E9PVB5 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ttc17E9PVB5 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ttc17E9PVB5 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ttc17E9PVB5 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ttc17E9PVB5 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Ttc17E9PVB5 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ttc17E9PVB5 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ttc17E9PVB5 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ttc17E9PVB5 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ttc17E9PVB5 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ttc17E9PVB5 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ttc17E9PVB5 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ttc17E9PVB5 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ttc17E9PVB5 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ttc17E9PVB5 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ttc17E9PVB5 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ttc17E9PVB5 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ttc17E9PVB5 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ttc17E9PVB5 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ttc17E9PVB5 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ttc17E9PVB5 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ttc17E9PVB5 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ttc17E9PVB5 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ttc17E9PVB5 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ttc17E9PVB5 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ttc17E9PVB5 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ttc17E9PVB5 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ttc17E9PVB5 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ttc17E9PVB5 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ttc17E9PVB5 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ttc17E9PVB5 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ttc17E9PVB5 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ttc17E9PVB5 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ttc17E9PVB5 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ttc17E9PVB5 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ttc17E9PVB5 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ttc17E9PVB5 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ttc17E9PVB5 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ttc17E9PVB5 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ttc17E9PVB5 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ttc17E9PVB5 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ttc17E9PVB5 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ttc17E9PVB5 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ttc17E9PVB5 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ttc17E9PVB5 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ttc17E9PVB5 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ttc17E9PVB5 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ttc17E9PVB5 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ttc17E9PVB5 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ttc17E9PVB5 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ttc17E9PVB5 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ttc17E9PVB5 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ttc17E9PVB5 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ttc17E9PVB5 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ttc17E9PVB5 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ttc17E9PVB5 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms