Protein–RNA interactions for Protein: E0CYV9

1110002E22Rik, RIKEN cDNA 1110002E22 gene, mousemouse

Predictions only

Length 1,786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1110002E22RikE0CYV9 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
1110002E22RikE0CYV9 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
1110002E22RikE0CYV9 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
1110002E22RikE0CYV9 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
1110002E22RikE0CYV9 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
1110002E22RikE0CYV9 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
1110002E22RikE0CYV9 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
1110002E22RikE0CYV9 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
1110002E22RikE0CYV9 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
1110002E22RikE0CYV9 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
1110002E22RikE0CYV9 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
1110002E22RikE0CYV9 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
1110002E22RikE0CYV9 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
1110002E22RikE0CYV9 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
1110002E22RikE0CYV9 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
1110002E22RikE0CYV9 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
1110002E22RikE0CYV9 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
1110002E22RikE0CYV9 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
1110002E22RikE0CYV9 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
1110002E22RikE0CYV9 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
1110002E22RikE0CYV9 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
1110002E22RikE0CYV9 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
1110002E22RikE0CYV9 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
1110002E22RikE0CYV9 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
1110002E22RikE0CYV9 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
1110002E22RikE0CYV9 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
1110002E22RikE0CYV9 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
1110002E22RikE0CYV9 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
1110002E22RikE0CYV9 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
1110002E22RikE0CYV9 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
1110002E22RikE0CYV9 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
1110002E22RikE0CYV9 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
1110002E22RikE0CYV9 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
1110002E22RikE0CYV9 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
1110002E22RikE0CYV9 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
1110002E22RikE0CYV9 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
1110002E22RikE0CYV9 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
1110002E22RikE0CYV9 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
1110002E22RikE0CYV9 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
1110002E22RikE0CYV9 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
1110002E22RikE0CYV9 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
1110002E22RikE0CYV9 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
1110002E22RikE0CYV9 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
1110002E22RikE0CYV9 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
1110002E22RikE0CYV9 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
1110002E22RikE0CYV9 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
1110002E22RikE0CYV9 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
1110002E22RikE0CYV9 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
1110002E22RikE0CYV9 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
1110002E22RikE0CYV9 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
1110002E22RikE0CYV9 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
1110002E22RikE0CYV9 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
1110002E22RikE0CYV9 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
1110002E22RikE0CYV9 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
1110002E22RikE0CYV9 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
1110002E22RikE0CYV9 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
1110002E22RikE0CYV9 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
1110002E22RikE0CYV9 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
1110002E22RikE0CYV9 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
1110002E22RikE0CYV9 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
1110002E22RikE0CYV9 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
1110002E22RikE0CYV9 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
1110002E22RikE0CYV9 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
1110002E22RikE0CYV9 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
1110002E22RikE0CYV9 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
1110002E22RikE0CYV9 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
1110002E22RikE0CYV9 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
1110002E22RikE0CYV9 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
1110002E22RikE0CYV9 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
1110002E22RikE0CYV9 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
1110002E22RikE0CYV9 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
1110002E22RikE0CYV9 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
1110002E22RikE0CYV9 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
1110002E22RikE0CYV9 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
1110002E22RikE0CYV9 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
1110002E22RikE0CYV9 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
1110002E22RikE0CYV9 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
1110002E22RikE0CYV9 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
1110002E22RikE0CYV9 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
1110002E22RikE0CYV9 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
1110002E22RikE0CYV9 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
1110002E22RikE0CYV9 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
1110002E22RikE0CYV9 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
1110002E22RikE0CYV9 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
1110002E22RikE0CYV9 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
1110002E22RikE0CYV9 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
1110002E22RikE0CYV9 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
1110002E22RikE0CYV9 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
1110002E22RikE0CYV9 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
1110002E22RikE0CYV9 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
1110002E22RikE0CYV9 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
1110002E22RikE0CYV9 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
1110002E22RikE0CYV9 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
1110002E22RikE0CYV9 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
1110002E22RikE0CYV9 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
1110002E22RikE0CYV9 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
1110002E22RikE0CYV9 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
1110002E22RikE0CYV9 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
1110002E22RikE0CYV9 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
1110002E22RikE0CYV9 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms