Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6J4

Vpreb3, Pre-B lymphocyte gene 3, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb3D3Z6J4 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Vpreb3D3Z6J4 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Vpreb3D3Z6J4 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Vpreb3D3Z6J4 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Vpreb3D3Z6J4 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Vpreb3D3Z6J4 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Vpreb3D3Z6J4 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Vpreb3D3Z6J4 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Vpreb3D3Z6J4 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Vpreb3D3Z6J4 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Vpreb3D3Z6J4 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Vpreb3D3Z6J4 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Vpreb3D3Z6J4 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Vpreb3D3Z6J4 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Vpreb3D3Z6J4 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Vpreb3D3Z6J4 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Vpreb3D3Z6J4 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Vpreb3D3Z6J4 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Vpreb3D3Z6J4 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Vpreb3D3Z6J4 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Vpreb3D3Z6J4 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Vpreb3D3Z6J4 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Vpreb3D3Z6J4 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Vpreb3D3Z6J4 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Vpreb3D3Z6J4 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Vpreb3D3Z6J4 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Vpreb3D3Z6J4 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Vpreb3D3Z6J4 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Vpreb3D3Z6J4 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Vpreb3D3Z6J4 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Vpreb3D3Z6J4 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Vpreb3D3Z6J4 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Vpreb3D3Z6J4 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Vpreb3D3Z6J4 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Vpreb3D3Z6J4 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Vpreb3D3Z6J4 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Vpreb3D3Z6J4 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Vpreb3D3Z6J4 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Vpreb3D3Z6J4 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Vpreb3D3Z6J4 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Vpreb3D3Z6J4 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Vpreb3D3Z6J4 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Vpreb3D3Z6J4 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Vpreb3D3Z6J4 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Vpreb3D3Z6J4 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Vpreb3D3Z6J4 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Vpreb3D3Z6J4 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Vpreb3D3Z6J4 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Vpreb3D3Z6J4 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Vpreb3D3Z6J4 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Vpreb3D3Z6J4 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Vpreb3D3Z6J4 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Vpreb3D3Z6J4 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Vpreb3D3Z6J4 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Vpreb3D3Z6J4 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Vpreb3D3Z6J4 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Vpreb3D3Z6J4 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Vpreb3D3Z6J4 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Vpreb3D3Z6J4 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vpreb3D3Z6J4 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vpreb3D3Z6J4 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vpreb3D3Z6J4 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vpreb3D3Z6J4 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vpreb3D3Z6J4 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vpreb3D3Z6J4 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vpreb3D3Z6J4 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vpreb3D3Z6J4 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Vpreb3D3Z6J4 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vpreb3D3Z6J4 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Vpreb3D3Z6J4 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vpreb3D3Z6J4 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vpreb3D3Z6J4 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vpreb3D3Z6J4 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vpreb3D3Z6J4 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vpreb3D3Z6J4 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vpreb3D3Z6J4 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vpreb3D3Z6J4 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vpreb3D3Z6J4 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Vpreb3D3Z6J4 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vpreb3D3Z6J4 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vpreb3D3Z6J4 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vpreb3D3Z6J4 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vpreb3D3Z6J4 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vpreb3D3Z6J4 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vpreb3D3Z6J4 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vpreb3D3Z6J4 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vpreb3D3Z6J4 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vpreb3D3Z6J4 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vpreb3D3Z6J4 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vpreb3D3Z6J4 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vpreb3D3Z6J4 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vpreb3D3Z6J4 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vpreb3D3Z6J4 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vpreb3D3Z6J4 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vpreb3D3Z6J4 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vpreb3D3Z6J4 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vpreb3D3Z6J4 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vpreb3D3Z6J4 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vpreb3D3Z6J4 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vpreb3D3Z6J4 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms