Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5L4

5430403G16Rik, RIKEN cDNA 5430403G16 gene, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5430403G16RikD3Z5L4 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
5430403G16RikD3Z5L4 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
5430403G16RikD3Z5L4 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
5430403G16RikD3Z5L4 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
5430403G16RikD3Z5L4 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
5430403G16RikD3Z5L4 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
5430403G16RikD3Z5L4 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
5430403G16RikD3Z5L4 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
5430403G16RikD3Z5L4 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
5430403G16RikD3Z5L4 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
5430403G16RikD3Z5L4 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
5430403G16RikD3Z5L4 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
5430403G16RikD3Z5L4 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
5430403G16RikD3Z5L4 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
5430403G16RikD3Z5L4 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
5430403G16RikD3Z5L4 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
5430403G16RikD3Z5L4 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
5430403G16RikD3Z5L4 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
5430403G16RikD3Z5L4 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
5430403G16RikD3Z5L4 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
5430403G16RikD3Z5L4 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
5430403G16RikD3Z5L4 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
5430403G16RikD3Z5L4 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
5430403G16RikD3Z5L4 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
5430403G16RikD3Z5L4 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
5430403G16RikD3Z5L4 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
5430403G16RikD3Z5L4 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
5430403G16RikD3Z5L4 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
5430403G16RikD3Z5L4 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
5430403G16RikD3Z5L4 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
5430403G16RikD3Z5L4 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
5430403G16RikD3Z5L4 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
5430403G16RikD3Z5L4 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
5430403G16RikD3Z5L4 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
5430403G16RikD3Z5L4 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
5430403G16RikD3Z5L4 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
5430403G16RikD3Z5L4 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
5430403G16RikD3Z5L4 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
5430403G16RikD3Z5L4 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
5430403G16RikD3Z5L4 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
5430403G16RikD3Z5L4 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
5430403G16RikD3Z5L4 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
5430403G16RikD3Z5L4 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
5430403G16RikD3Z5L4 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
5430403G16RikD3Z5L4 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
5430403G16RikD3Z5L4 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
5430403G16RikD3Z5L4 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
5430403G16RikD3Z5L4 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
5430403G16RikD3Z5L4 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
5430403G16RikD3Z5L4 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
5430403G16RikD3Z5L4 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
5430403G16RikD3Z5L4 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
5430403G16RikD3Z5L4 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
5430403G16RikD3Z5L4 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
5430403G16RikD3Z5L4 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
5430403G16RikD3Z5L4 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
5430403G16RikD3Z5L4 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
5430403G16RikD3Z5L4 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
5430403G16RikD3Z5L4 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
5430403G16RikD3Z5L4 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
5430403G16RikD3Z5L4 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
5430403G16RikD3Z5L4 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
5430403G16RikD3Z5L4 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
5430403G16RikD3Z5L4 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
5430403G16RikD3Z5L4 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
5430403G16RikD3Z5L4 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
5430403G16RikD3Z5L4 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
5430403G16RikD3Z5L4 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
5430403G16RikD3Z5L4 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
5430403G16RikD3Z5L4 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
5430403G16RikD3Z5L4 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
5430403G16RikD3Z5L4 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
5430403G16RikD3Z5L4 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
5430403G16RikD3Z5L4 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
5430403G16RikD3Z5L4 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
5430403G16RikD3Z5L4 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
5430403G16RikD3Z5L4 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
5430403G16RikD3Z5L4 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
5430403G16RikD3Z5L4 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
5430403G16RikD3Z5L4 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
5430403G16RikD3Z5L4 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
5430403G16RikD3Z5L4 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
5430403G16RikD3Z5L4 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
5430403G16RikD3Z5L4 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
5430403G16RikD3Z5L4 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
5430403G16RikD3Z5L4 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
5430403G16RikD3Z5L4 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
5430403G16RikD3Z5L4 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
5430403G16RikD3Z5L4 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
5430403G16RikD3Z5L4 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
5430403G16RikD3Z5L4 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
5430403G16RikD3Z5L4 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
5430403G16RikD3Z5L4 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
5430403G16RikD3Z5L4 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
5430403G16RikD3Z5L4 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
5430403G16RikD3Z5L4 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
5430403G16RikD3Z5L4 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
5430403G16RikD3Z5L4 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
5430403G16RikD3Z5L4 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
5430403G16RikD3Z5L4 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms