Protein–RNA interactions for Protein: D3YZV8

Ccdc8, Coiled-coil domain-containing protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc8D3YZV8 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc8D3YZV8 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc8D3YZV8 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc8D3YZV8 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc8D3YZV8 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc8D3YZV8 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc8D3YZV8 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc8D3YZV8 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc8D3YZV8 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc8D3YZV8 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc8D3YZV8 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc8D3YZV8 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc8D3YZV8 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc8D3YZV8 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc8D3YZV8 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc8D3YZV8 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc8D3YZV8 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc8D3YZV8 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc8D3YZV8 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc8D3YZV8 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc8D3YZV8 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc8D3YZV8 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc8D3YZV8 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc8D3YZV8 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc8D3YZV8 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc8D3YZV8 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc8D3YZV8 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc8D3YZV8 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc8D3YZV8 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc8D3YZV8 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc8D3YZV8 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc8D3YZV8 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc8D3YZV8 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc8D3YZV8 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc8D3YZV8 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc8D3YZV8 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc8D3YZV8 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc8D3YZV8 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc8D3YZV8 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc8D3YZV8 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc8D3YZV8 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc8D3YZV8 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc8D3YZV8 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc8D3YZV8 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc8D3YZV8 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc8D3YZV8 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc8D3YZV8 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc8D3YZV8 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc8D3YZV8 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc8D3YZV8 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc8D3YZV8 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc8D3YZV8 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc8D3YZV8 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc8D3YZV8 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc8D3YZV8 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc8D3YZV8 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc8D3YZV8 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc8D3YZV8 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc8D3YZV8 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc8D3YZV8 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc8D3YZV8 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc8D3YZV8 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc8D3YZV8 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc8D3YZV8 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc8D3YZV8 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc8D3YZV8 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc8D3YZV8 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc8D3YZV8 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc8D3YZV8 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc8D3YZV8 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc8D3YZV8 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc8D3YZV8 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc8D3YZV8 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc8D3YZV8 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc8D3YZV8 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc8D3YZV8 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc8D3YZV8 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc8D3YZV8 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc8D3YZV8 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc8D3YZV8 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc8D3YZV8 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc8D3YZV8 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc8D3YZV8 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc8D3YZV8 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc8D3YZV8 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc8D3YZV8 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc8D3YZV8 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc8D3YZV8 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc8D3YZV8 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc8D3YZV8 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc8D3YZV8 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc8D3YZV8 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc8D3YZV8 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc8D3YZV8 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc8D3YZV8 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc8D3YZV8 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc8D3YZV8 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc8D3YZV8 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc8D3YZV8 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc8D3YZV8 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms