Protein–RNA interactions for Protein: D3YYI7

Rnf217, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF217, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf217D3YYI7 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf217D3YYI7 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf217D3YYI7 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf217D3YYI7 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf217D3YYI7 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf217D3YYI7 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf217D3YYI7 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf217D3YYI7 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf217D3YYI7 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf217D3YYI7 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf217D3YYI7 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf217D3YYI7 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf217D3YYI7 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf217D3YYI7 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf217D3YYI7 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf217D3YYI7 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnf217D3YYI7 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnf217D3YYI7 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnf217D3YYI7 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnf217D3YYI7 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnf217D3YYI7 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnf217D3YYI7 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnf217D3YYI7 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnf217D3YYI7 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnf217D3YYI7 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnf217D3YYI7 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnf217D3YYI7 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnf217D3YYI7 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnf217D3YYI7 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnf217D3YYI7 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnf217D3YYI7 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnf217D3YYI7 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnf217D3YYI7 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnf217D3YYI7 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnf217D3YYI7 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnf217D3YYI7 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Rnf217D3YYI7 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnf217D3YYI7 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnf217D3YYI7 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnf217D3YYI7 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Rnf217D3YYI7 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Rnf217D3YYI7 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rnf217D3YYI7 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rnf217D3YYI7 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rnf217D3YYI7 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rnf217D3YYI7 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rnf217D3YYI7 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rnf217D3YYI7 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Rnf217D3YYI7 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Rnf217D3YYI7 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rnf217D3YYI7 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rnf217D3YYI7 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rnf217D3YYI7 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rnf217D3YYI7 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Rnf217D3YYI7 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rnf217D3YYI7 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rnf217D3YYI7 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rnf217D3YYI7 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rnf217D3YYI7 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rnf217D3YYI7 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rnf217D3YYI7 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rnf217D3YYI7 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rnf217D3YYI7 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rnf217D3YYI7 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rnf217D3YYI7 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rnf217D3YYI7 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Rnf217D3YYI7 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Rnf217D3YYI7 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Rnf217D3YYI7 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Rnf217D3YYI7 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
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