Protein–RNA interactions for Protein: B4XVQ1

Phf11b, PHD finger protein 11B, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11bB4XVQ1 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Phf11bB4XVQ1 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Phf11bB4XVQ1 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Phf11bB4XVQ1 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Phf11bB4XVQ1 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Phf11bB4XVQ1 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Phf11bB4XVQ1 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Phf11bB4XVQ1 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Phf11bB4XVQ1 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Phf11bB4XVQ1 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Phf11bB4XVQ1 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Phf11bB4XVQ1 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Phf11bB4XVQ1 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Phf11bB4XVQ1 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Phf11bB4XVQ1 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Phf11bB4XVQ1 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Phf11bB4XVQ1 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Phf11bB4XVQ1 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Phf11bB4XVQ1 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Phf11bB4XVQ1 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Phf11bB4XVQ1 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Phf11bB4XVQ1 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Phf11bB4XVQ1 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Phf11bB4XVQ1 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Phf11bB4XVQ1 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Phf11bB4XVQ1 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Phf11bB4XVQ1 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Phf11bB4XVQ1 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Phf11bB4XVQ1 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Phf11bB4XVQ1 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Phf11bB4XVQ1 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Phf11bB4XVQ1 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Phf11bB4XVQ1 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Phf11bB4XVQ1 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Phf11bB4XVQ1 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Phf11bB4XVQ1 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Phf11bB4XVQ1 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Phf11bB4XVQ1 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Phf11bB4XVQ1 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Phf11bB4XVQ1 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Phf11bB4XVQ1 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Phf11bB4XVQ1 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Phf11bB4XVQ1 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Phf11bB4XVQ1 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Phf11bB4XVQ1 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Phf11bB4XVQ1 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Phf11bB4XVQ1 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Phf11bB4XVQ1 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Phf11bB4XVQ1 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Phf11bB4XVQ1 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Phf11bB4XVQ1 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Phf11bB4XVQ1 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Phf11bB4XVQ1 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Phf11bB4XVQ1 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Phf11bB4XVQ1 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Phf11bB4XVQ1 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Phf11bB4XVQ1 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Phf11bB4XVQ1 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Phf11bB4XVQ1 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Phf11bB4XVQ1 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Phf11bB4XVQ1 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Phf11bB4XVQ1 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Phf11bB4XVQ1 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Phf11bB4XVQ1 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Phf11bB4XVQ1 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Phf11bB4XVQ1 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Phf11bB4XVQ1 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Phf11bB4XVQ1 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Phf11bB4XVQ1 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Phf11bB4XVQ1 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Phf11bB4XVQ1 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Phf11bB4XVQ1 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Phf11bB4XVQ1 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Phf11bB4XVQ1 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Phf11bB4XVQ1 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Phf11bB4XVQ1 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Phf11bB4XVQ1 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Phf11bB4XVQ1 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Phf11bB4XVQ1 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Phf11bB4XVQ1 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Phf11bB4XVQ1 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Phf11bB4XVQ1 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Phf11bB4XVQ1 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Phf11bB4XVQ1 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Phf11bB4XVQ1 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Phf11bB4XVQ1 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Phf11bB4XVQ1 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Phf11bB4XVQ1 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Phf11bB4XVQ1 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Phf11bB4XVQ1 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Phf11bB4XVQ1 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Phf11bB4XVQ1 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Phf11bB4XVQ1 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Phf11bB4XVQ1 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Phf11bB4XVQ1 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Phf11bB4XVQ1 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Phf11bB4XVQ1 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Phf11bB4XVQ1 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Phf11bB4XVQ1 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Phf11bB4XVQ1 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms