Protein–RNA interactions for Protein: B4XVP9

Phf11c, PHD finger protein 11C, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11cB4XVP9 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Phf11cB4XVP9 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Phf11cB4XVP9 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Phf11cB4XVP9 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Phf11cB4XVP9 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Phf11cB4XVP9 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Phf11cB4XVP9 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Phf11cB4XVP9 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Phf11cB4XVP9 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Phf11cB4XVP9 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Phf11cB4XVP9 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Phf11cB4XVP9 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Phf11cB4XVP9 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Phf11cB4XVP9 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Phf11cB4XVP9 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Phf11cB4XVP9 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Phf11cB4XVP9 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Phf11cB4XVP9 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Phf11cB4XVP9 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Phf11cB4XVP9 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Phf11cB4XVP9 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Phf11cB4XVP9 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Phf11cB4XVP9 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Phf11cB4XVP9 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Phf11cB4XVP9 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Phf11cB4XVP9 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Phf11cB4XVP9 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Phf11cB4XVP9 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Phf11cB4XVP9 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Phf11cB4XVP9 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Phf11cB4XVP9 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Phf11cB4XVP9 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Phf11cB4XVP9 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Phf11cB4XVP9 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Phf11cB4XVP9 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Phf11cB4XVP9 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Phf11cB4XVP9 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Phf11cB4XVP9 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Phf11cB4XVP9 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Phf11cB4XVP9 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Phf11cB4XVP9 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Phf11cB4XVP9 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Phf11cB4XVP9 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Phf11cB4XVP9 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Phf11cB4XVP9 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Phf11cB4XVP9 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Phf11cB4XVP9 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Phf11cB4XVP9 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Phf11cB4XVP9 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Phf11cB4XVP9 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Phf11cB4XVP9 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Phf11cB4XVP9 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Phf11cB4XVP9 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Phf11cB4XVP9 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Phf11cB4XVP9 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Phf11cB4XVP9 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Phf11cB4XVP9 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Phf11cB4XVP9 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Phf11cB4XVP9 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Phf11cB4XVP9 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Phf11cB4XVP9 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Phf11cB4XVP9 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Phf11cB4XVP9 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Phf11cB4XVP9 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Phf11cB4XVP9 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Phf11cB4XVP9 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Phf11cB4XVP9 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Phf11cB4XVP9 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Phf11cB4XVP9 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Phf11cB4XVP9 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Phf11cB4XVP9 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Phf11cB4XVP9 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Phf11cB4XVP9 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Phf11cB4XVP9 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Phf11cB4XVP9 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Phf11cB4XVP9 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Phf11cB4XVP9 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Phf11cB4XVP9 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Phf11cB4XVP9 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Phf11cB4XVP9 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Phf11cB4XVP9 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Phf11cB4XVP9 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Phf11cB4XVP9 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Phf11cB4XVP9 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Phf11cB4XVP9 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Phf11cB4XVP9 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Phf11cB4XVP9 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Phf11cB4XVP9 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Phf11cB4XVP9 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Phf11cB4XVP9 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Phf11cB4XVP9 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Phf11cB4XVP9 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Phf11cB4XVP9 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Phf11cB4XVP9 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Phf11cB4XVP9 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Phf11cB4XVP9 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Phf11cB4XVP9 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Phf11cB4XVP9 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Phf11cB4XVP9 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Phf11cB4XVP9 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms