Protein–RNA interactions for Protein: B2RXA8

Gabrr3, Gamma-aminobutyric acid (GABA) receptor, rho 3, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabrr3B2RXA8 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gabrr3B2RXA8 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gabrr3B2RXA8 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gabrr3B2RXA8 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gabrr3B2RXA8 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gabrr3B2RXA8 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gabrr3B2RXA8 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gabrr3B2RXA8 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gabrr3B2RXA8 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gabrr3B2RXA8 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gabrr3B2RXA8 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gabrr3B2RXA8 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gabrr3B2RXA8 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gabrr3B2RXA8 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gabrr3B2RXA8 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gabrr3B2RXA8 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gabrr3B2RXA8 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gabrr3B2RXA8 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gabrr3B2RXA8 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gabrr3B2RXA8 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gabrr3B2RXA8 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gabrr3B2RXA8 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gabrr3B2RXA8 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gabrr3B2RXA8 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gabrr3B2RXA8 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gabrr3B2RXA8 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gabrr3B2RXA8 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gabrr3B2RXA8 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gabrr3B2RXA8 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gabrr3B2RXA8 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gabrr3B2RXA8 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gabrr3B2RXA8 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gabrr3B2RXA8 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gabrr3B2RXA8 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gabrr3B2RXA8 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gabrr3B2RXA8 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gabrr3B2RXA8 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gabrr3B2RXA8 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gabrr3B2RXA8 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gabrr3B2RXA8 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gabrr3B2RXA8 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gabrr3B2RXA8 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gabrr3B2RXA8 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gabrr3B2RXA8 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gabrr3B2RXA8 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gabrr3B2RXA8 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gabrr3B2RXA8 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gabrr3B2RXA8 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gabrr3B2RXA8 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gabrr3B2RXA8 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gabrr3B2RXA8 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gabrr3B2RXA8 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gabrr3B2RXA8 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gabrr3B2RXA8 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gabrr3B2RXA8 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gabrr3B2RXA8 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gabrr3B2RXA8 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gabrr3B2RXA8 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gabrr3B2RXA8 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gabrr3B2RXA8 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gabrr3B2RXA8 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gabrr3B2RXA8 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gabrr3B2RXA8 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gabrr3B2RXA8 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gabrr3B2RXA8 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gabrr3B2RXA8 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gabrr3B2RXA8 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gabrr3B2RXA8 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gabrr3B2RXA8 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gabrr3B2RXA8 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gabrr3B2RXA8 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gabrr3B2RXA8 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gabrr3B2RXA8 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gabrr3B2RXA8 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gabrr3B2RXA8 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gabrr3B2RXA8 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gabrr3B2RXA8 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gabrr3B2RXA8 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gabrr3B2RXA8 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gabrr3B2RXA8 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gabrr3B2RXA8 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gabrr3B2RXA8 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gabrr3B2RXA8 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gabrr3B2RXA8 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gabrr3B2RXA8 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gabrr3B2RXA8 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gabrr3B2RXA8 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gabrr3B2RXA8 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gabrr3B2RXA8 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gabrr3B2RXA8 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gabrr3B2RXA8 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gabrr3B2RXA8 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gabrr3B2RXA8 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gabrr3B2RXA8 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gabrr3B2RXA8 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gabrr3B2RXA8 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gabrr3B2RXA8 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gabrr3B2RXA8 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gabrr3B2RXA8 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gabrr3B2RXA8 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.5 ms