Protein–RNA interactions for Protein: B2RW27

1700018F24Rik, 1700018F24Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700018F24RikB2RW27 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
1700018F24RikB2RW27 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
1700018F24RikB2RW27 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
1700018F24RikB2RW27 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
1700018F24RikB2RW27 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
1700018F24RikB2RW27 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
1700018F24RikB2RW27 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
1700018F24RikB2RW27 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
1700018F24RikB2RW27 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
1700018F24RikB2RW27 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
1700018F24RikB2RW27 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
1700018F24RikB2RW27 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
1700018F24RikB2RW27 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
1700018F24RikB2RW27 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
1700018F24RikB2RW27 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
1700018F24RikB2RW27 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
1700018F24RikB2RW27 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
1700018F24RikB2RW27 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
1700018F24RikB2RW27 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
1700018F24RikB2RW27 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
1700018F24RikB2RW27 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
1700018F24RikB2RW27 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
1700018F24RikB2RW27 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
1700018F24RikB2RW27 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
1700018F24RikB2RW27 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
1700018F24RikB2RW27 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
1700018F24RikB2RW27 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
1700018F24RikB2RW27 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
1700018F24RikB2RW27 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
1700018F24RikB2RW27 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
1700018F24RikB2RW27 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
1700018F24RikB2RW27 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
1700018F24RikB2RW27 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
1700018F24RikB2RW27 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
1700018F24RikB2RW27 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
1700018F24RikB2RW27 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
1700018F24RikB2RW27 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
1700018F24RikB2RW27 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
1700018F24RikB2RW27 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
1700018F24RikB2RW27 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
1700018F24RikB2RW27 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
1700018F24RikB2RW27 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
1700018F24RikB2RW27 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
1700018F24RikB2RW27 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
1700018F24RikB2RW27 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
1700018F24RikB2RW27 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
1700018F24RikB2RW27 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
1700018F24RikB2RW27 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
1700018F24RikB2RW27 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
1700018F24RikB2RW27 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
1700018F24RikB2RW27 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
1700018F24RikB2RW27 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
1700018F24RikB2RW27 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
1700018F24RikB2RW27 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
1700018F24RikB2RW27 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
1700018F24RikB2RW27 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
1700018F24RikB2RW27 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
1700018F24RikB2RW27 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
1700018F24RikB2RW27 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
1700018F24RikB2RW27 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
1700018F24RikB2RW27 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
1700018F24RikB2RW27 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
1700018F24RikB2RW27 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
1700018F24RikB2RW27 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
1700018F24RikB2RW27 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
1700018F24RikB2RW27 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
1700018F24RikB2RW27 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
1700018F24RikB2RW27 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
1700018F24RikB2RW27 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
1700018F24RikB2RW27 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
1700018F24RikB2RW27 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
1700018F24RikB2RW27 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
1700018F24RikB2RW27 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
1700018F24RikB2RW27 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
1700018F24RikB2RW27 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
1700018F24RikB2RW27 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
1700018F24RikB2RW27 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
1700018F24RikB2RW27 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
1700018F24RikB2RW27 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
1700018F24RikB2RW27 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
1700018F24RikB2RW27 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
1700018F24RikB2RW27 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
1700018F24RikB2RW27 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
1700018F24RikB2RW27 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
1700018F24RikB2RW27 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
1700018F24RikB2RW27 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
1700018F24RikB2RW27 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
1700018F24RikB2RW27 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
1700018F24RikB2RW27 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
1700018F24RikB2RW27 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
1700018F24RikB2RW27 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
1700018F24RikB2RW27 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
1700018F24RikB2RW27 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
1700018F24RikB2RW27 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
1700018F24RikB2RW27 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
1700018F24RikB2RW27 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
1700018F24RikB2RW27 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
1700018F24RikB2RW27 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
1700018F24RikB2RW27 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
1700018F24RikB2RW27 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms