Protein–RNA interactions for Protein: B2RTN3

Zscan5b, Zinc finger and SCAN domain-containing 5B, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zscan5bB2RTN3 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Zscan5bB2RTN3 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Zscan5bB2RTN3 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Zscan5bB2RTN3 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Zscan5bB2RTN3 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Zscan5bB2RTN3 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Zscan5bB2RTN3 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Zscan5bB2RTN3 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Zscan5bB2RTN3 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Zscan5bB2RTN3 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Zscan5bB2RTN3 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Zscan5bB2RTN3 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Zscan5bB2RTN3 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Zscan5bB2RTN3 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Zscan5bB2RTN3 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Zscan5bB2RTN3 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Zscan5bB2RTN3 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Zscan5bB2RTN3 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Zscan5bB2RTN3 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Zscan5bB2RTN3 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Zscan5bB2RTN3 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Zscan5bB2RTN3 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Zscan5bB2RTN3 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Zscan5bB2RTN3 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Zscan5bB2RTN3 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Zscan5bB2RTN3 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Zscan5bB2RTN3 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Zscan5bB2RTN3 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Zscan5bB2RTN3 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Zscan5bB2RTN3 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Zscan5bB2RTN3 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Zscan5bB2RTN3 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Zscan5bB2RTN3 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Zscan5bB2RTN3 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Zscan5bB2RTN3 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Zscan5bB2RTN3 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Zscan5bB2RTN3 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Zscan5bB2RTN3 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Zscan5bB2RTN3 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Zscan5bB2RTN3 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Zscan5bB2RTN3 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Zscan5bB2RTN3 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Zscan5bB2RTN3 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Zscan5bB2RTN3 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Zscan5bB2RTN3 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Zscan5bB2RTN3 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Zscan5bB2RTN3 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Zscan5bB2RTN3 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Zscan5bB2RTN3 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Zscan5bB2RTN3 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Zscan5bB2RTN3 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Zscan5bB2RTN3 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Zscan5bB2RTN3 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Zscan5bB2RTN3 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Zscan5bB2RTN3 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Zscan5bB2RTN3 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Zscan5bB2RTN3 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Zscan5bB2RTN3 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Zscan5bB2RTN3 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Zscan5bB2RTN3 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Zscan5bB2RTN3 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Zscan5bB2RTN3 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Zscan5bB2RTN3 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Zscan5bB2RTN3 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Zscan5bB2RTN3 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Zscan5bB2RTN3 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Zscan5bB2RTN3 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Zscan5bB2RTN3 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Zscan5bB2RTN3 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Zscan5bB2RTN3 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Zscan5bB2RTN3 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Zscan5bB2RTN3 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Zscan5bB2RTN3 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Zscan5bB2RTN3 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Zscan5bB2RTN3 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Zscan5bB2RTN3 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Zscan5bB2RTN3 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Zscan5bB2RTN3 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Zscan5bB2RTN3 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Zscan5bB2RTN3 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Zscan5bB2RTN3 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Zscan5bB2RTN3 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Zscan5bB2RTN3 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Zscan5bB2RTN3 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Zscan5bB2RTN3 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Zscan5bB2RTN3 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Zscan5bB2RTN3 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Zscan5bB2RTN3 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Zscan5bB2RTN3 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Zscan5bB2RTN3 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Zscan5bB2RTN3 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Zscan5bB2RTN3 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Zscan5bB2RTN3 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Zscan5bB2RTN3 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Zscan5bB2RTN3 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Zscan5bB2RTN3 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Zscan5bB2RTN3 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Zscan5bB2RTN3 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Zscan5bB2RTN3 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Zscan5bB2RTN3 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms