Protein–RNA interactions for Protein: B2RS91

Rrn3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

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Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrn3B2RS91 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rrn3B2RS91 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rrn3B2RS91 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rrn3B2RS91 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rrn3B2RS91 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rrn3B2RS91 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rrn3B2RS91 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rrn3B2RS91 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rrn3B2RS91 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rrn3B2RS91 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rrn3B2RS91 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rrn3B2RS91 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rrn3B2RS91 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rrn3B2RS91 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rrn3B2RS91 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rrn3B2RS91 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rrn3B2RS91 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rrn3B2RS91 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rrn3B2RS91 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rrn3B2RS91 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rrn3B2RS91 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rrn3B2RS91 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rrn3B2RS91 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rrn3B2RS91 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rrn3B2RS91 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rrn3B2RS91 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Rrn3B2RS91 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rrn3B2RS91 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rrn3B2RS91 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rrn3B2RS91 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rrn3B2RS91 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rrn3B2RS91 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rrn3B2RS91 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rrn3B2RS91 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rrn3B2RS91 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rrn3B2RS91 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rrn3B2RS91 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rrn3B2RS91 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rrn3B2RS91 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rrn3B2RS91 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rrn3B2RS91 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rrn3B2RS91 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rrn3B2RS91 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rrn3B2RS91 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rrn3B2RS91 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rrn3B2RS91 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rrn3B2RS91 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Rrn3B2RS91 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Rrn3B2RS91 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rrn3B2RS91 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Rrn3B2RS91 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rrn3B2RS91 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rrn3B2RS91 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rrn3B2RS91 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Rrn3B2RS91 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rrn3B2RS91 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Rrn3B2RS91 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rrn3B2RS91 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rrn3B2RS91 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rrn3B2RS91 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rrn3B2RS91 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rrn3B2RS91 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rrn3B2RS91 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rrn3B2RS91 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rrn3B2RS91 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rrn3B2RS91 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rrn3B2RS91 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Rrn3B2RS91 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rrn3B2RS91 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rrn3B2RS91 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rrn3B2RS91 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rrn3B2RS91 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rrn3B2RS91 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rrn3B2RS91 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rrn3B2RS91 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rrn3B2RS91 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rrn3B2RS91 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rrn3B2RS91 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rrn3B2RS91 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rrn3B2RS91 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rrn3B2RS91 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rrn3B2RS91 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rrn3B2RS91 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rrn3B2RS91 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rrn3B2RS91 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rrn3B2RS91 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rrn3B2RS91 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rrn3B2RS91 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rrn3B2RS91 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rrn3B2RS91 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rrn3B2RS91 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rrn3B2RS91 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rrn3B2RS91 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rrn3B2RS91 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rrn3B2RS91 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rrn3B2RS91 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rrn3B2RS91 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rrn3B2RS91 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rrn3B2RS91 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rrn3B2RS91 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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