Protein–RNA interactions for Protein: B1AYM9

CK137956, cDNA sequence CK137956, mousemouse

Predictions only

Length 596 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CK137956B1AYM9 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CK137956B1AYM9 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CK137956B1AYM9 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CK137956B1AYM9 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CK137956B1AYM9 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CK137956B1AYM9 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CK137956B1AYM9 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CK137956B1AYM9 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CK137956B1AYM9 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CK137956B1AYM9 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CK137956B1AYM9 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CK137956B1AYM9 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CK137956B1AYM9 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CK137956B1AYM9 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CK137956B1AYM9 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CK137956B1AYM9 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CK137956B1AYM9 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CK137956B1AYM9 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CK137956B1AYM9 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CK137956B1AYM9 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CK137956B1AYM9 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CK137956B1AYM9 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CK137956B1AYM9 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CK137956B1AYM9 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CK137956B1AYM9 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CK137956B1AYM9 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CK137956B1AYM9 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CK137956B1AYM9 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CK137956B1AYM9 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CK137956B1AYM9 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CK137956B1AYM9 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CK137956B1AYM9 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CK137956B1AYM9 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CK137956B1AYM9 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CK137956B1AYM9 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CK137956B1AYM9 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CK137956B1AYM9 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CK137956B1AYM9 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CK137956B1AYM9 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CK137956B1AYM9 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CK137956B1AYM9 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CK137956B1AYM9 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CK137956B1AYM9 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CK137956B1AYM9 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CK137956B1AYM9 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CK137956B1AYM9 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CK137956B1AYM9 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CK137956B1AYM9 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CK137956B1AYM9 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CK137956B1AYM9 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CK137956B1AYM9 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CK137956B1AYM9 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CK137956B1AYM9 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CK137956B1AYM9 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CK137956B1AYM9 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CK137956B1AYM9 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CK137956B1AYM9 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CK137956B1AYM9 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CK137956B1AYM9 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CK137956B1AYM9 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CK137956B1AYM9 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CK137956B1AYM9 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CK137956B1AYM9 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CK137956B1AYM9 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CK137956B1AYM9 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CK137956B1AYM9 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CK137956B1AYM9 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CK137956B1AYM9 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CK137956B1AYM9 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CK137956B1AYM9 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CK137956B1AYM9 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CK137956B1AYM9 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CK137956B1AYM9 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CK137956B1AYM9 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CK137956B1AYM9 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CK137956B1AYM9 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CK137956B1AYM9 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CK137956B1AYM9 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CK137956B1AYM9 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CK137956B1AYM9 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CK137956B1AYM9 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CK137956B1AYM9 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CK137956B1AYM9 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CK137956B1AYM9 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CK137956B1AYM9 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CK137956B1AYM9 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CK137956B1AYM9 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CK137956B1AYM9 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CK137956B1AYM9 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CK137956B1AYM9 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CK137956B1AYM9 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CK137956B1AYM9 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CK137956B1AYM9 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CK137956B1AYM9 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CK137956B1AYM9 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CK137956B1AYM9 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CK137956B1AYM9 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CK137956B1AYM9 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CK137956B1AYM9 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CK137956B1AYM9 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms