Protein–RNA interactions for Protein: B1AYB6

Mbd5, Methyl-CpG-binding domain protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd5B1AYB6 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mbd5B1AYB6 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mbd5B1AYB6 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mbd5B1AYB6 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mbd5B1AYB6 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mbd5B1AYB6 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mbd5B1AYB6 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mbd5B1AYB6 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mbd5B1AYB6 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mbd5B1AYB6 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mbd5B1AYB6 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mbd5B1AYB6 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Mbd5B1AYB6 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Mbd5B1AYB6 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Mbd5B1AYB6 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Mbd5B1AYB6 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Mbd5B1AYB6 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Mbd5B1AYB6 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Mbd5B1AYB6 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Mbd5B1AYB6 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Mbd5B1AYB6 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mbd5B1AYB6 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mbd5B1AYB6 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mbd5B1AYB6 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mbd5B1AYB6 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mbd5B1AYB6 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mbd5B1AYB6 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mbd5B1AYB6 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mbd5B1AYB6 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mbd5B1AYB6 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mbd5B1AYB6 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mbd5B1AYB6 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mbd5B1AYB6 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mbd5B1AYB6 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mbd5B1AYB6 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Mbd5B1AYB6 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mbd5B1AYB6 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mbd5B1AYB6 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mbd5B1AYB6 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mbd5B1AYB6 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mbd5B1AYB6 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Mbd5B1AYB6 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Mbd5B1AYB6 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Mbd5B1AYB6 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Mbd5B1AYB6 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Mbd5B1AYB6 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Mbd5B1AYB6 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Mbd5B1AYB6 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Mbd5B1AYB6 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Mbd5B1AYB6 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Mbd5B1AYB6 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Mbd5B1AYB6 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Mbd5B1AYB6 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Mbd5B1AYB6 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Mbd5B1AYB6 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Mbd5B1AYB6 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Mbd5B1AYB6 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Mbd5B1AYB6 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Mbd5B1AYB6 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Mbd5B1AYB6 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Mbd5B1AYB6 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Mbd5B1AYB6 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Mbd5B1AYB6 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Mbd5B1AYB6 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Mbd5B1AYB6 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Mbd5B1AYB6 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Mbd5B1AYB6 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Mbd5B1AYB6 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Mbd5B1AYB6 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Mbd5B1AYB6 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Mbd5B1AYB6 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Mbd5B1AYB6 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Mbd5B1AYB6 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Mbd5B1AYB6 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Mbd5B1AYB6 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Mbd5B1AYB6 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Mbd5B1AYB6 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Mbd5B1AYB6 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Mbd5B1AYB6 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Mbd5B1AYB6 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Mbd5B1AYB6 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Mbd5B1AYB6 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Mbd5B1AYB6 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Mbd5B1AYB6 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Mbd5B1AYB6 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Mbd5B1AYB6 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Mbd5B1AYB6 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Mbd5B1AYB6 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Mbd5B1AYB6 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Mbd5B1AYB6 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Mbd5B1AYB6 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Mbd5B1AYB6 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
Mbd5B1AYB6 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Mbd5B1AYB6 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Mbd5B1AYB6 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Mbd5B1AYB6 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Mbd5B1AYB6 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Mbd5B1AYB6 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Mbd5B1AYB6 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Mbd5B1AYB6 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms