Protein–RNA interactions for Protein: B1ATG9

Trabd2b, Metalloprotease TIKI2, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trabd2bB1ATG9 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trabd2bB1ATG9 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trabd2bB1ATG9 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trabd2bB1ATG9 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trabd2bB1ATG9 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trabd2bB1ATG9 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trabd2bB1ATG9 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trabd2bB1ATG9 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trabd2bB1ATG9 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trabd2bB1ATG9 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trabd2bB1ATG9 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trabd2bB1ATG9 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trabd2bB1ATG9 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trabd2bB1ATG9 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trabd2bB1ATG9 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trabd2bB1ATG9 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trabd2bB1ATG9 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trabd2bB1ATG9 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trabd2bB1ATG9 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trabd2bB1ATG9 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trabd2bB1ATG9 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trabd2bB1ATG9 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trabd2bB1ATG9 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trabd2bB1ATG9 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trabd2bB1ATG9 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trabd2bB1ATG9 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trabd2bB1ATG9 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trabd2bB1ATG9 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trabd2bB1ATG9 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Trabd2bB1ATG9 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trabd2bB1ATG9 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Trabd2bB1ATG9 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Trabd2bB1ATG9 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trabd2bB1ATG9 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trabd2bB1ATG9 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trabd2bB1ATG9 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trabd2bB1ATG9 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trabd2bB1ATG9 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trabd2bB1ATG9 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trabd2bB1ATG9 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trabd2bB1ATG9 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trabd2bB1ATG9 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trabd2bB1ATG9 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trabd2bB1ATG9 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trabd2bB1ATG9 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trabd2bB1ATG9 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trabd2bB1ATG9 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trabd2bB1ATG9 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trabd2bB1ATG9 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trabd2bB1ATG9 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trabd2bB1ATG9 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trabd2bB1ATG9 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trabd2bB1ATG9 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trabd2bB1ATG9 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trabd2bB1ATG9 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trabd2bB1ATG9 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trabd2bB1ATG9 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trabd2bB1ATG9 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trabd2bB1ATG9 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trabd2bB1ATG9 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trabd2bB1ATG9 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trabd2bB1ATG9 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trabd2bB1ATG9 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trabd2bB1ATG9 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trabd2bB1ATG9 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trabd2bB1ATG9 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trabd2bB1ATG9 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trabd2bB1ATG9 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trabd2bB1ATG9 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trabd2bB1ATG9 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trabd2bB1ATG9 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trabd2bB1ATG9 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trabd2bB1ATG9 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trabd2bB1ATG9 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trabd2bB1ATG9 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trabd2bB1ATG9 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trabd2bB1ATG9 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trabd2bB1ATG9 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trabd2bB1ATG9 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trabd2bB1ATG9 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trabd2bB1ATG9 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Trabd2bB1ATG9 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trabd2bB1ATG9 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trabd2bB1ATG9 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trabd2bB1ATG9 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trabd2bB1ATG9 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trabd2bB1ATG9 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trabd2bB1ATG9 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trabd2bB1ATG9 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trabd2bB1ATG9 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trabd2bB1ATG9 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trabd2bB1ATG9 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trabd2bB1ATG9 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trabd2bB1ATG9 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trabd2bB1ATG9 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trabd2bB1ATG9 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trabd2bB1ATG9 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trabd2bB1ATG9 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trabd2bB1ATG9 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trabd2bB1ATG9 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.2 ms