Protein–RNA interactions for Protein: A3KGF9

Ccdc9b, Coiled-coil domain-containing protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc9bA3KGF9 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc9bA3KGF9 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc9bA3KGF9 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc9bA3KGF9 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc9bA3KGF9 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc9bA3KGF9 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc9bA3KGF9 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc9bA3KGF9 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc9bA3KGF9 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc9bA3KGF9 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc9bA3KGF9 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc9bA3KGF9 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc9bA3KGF9 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc9bA3KGF9 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc9bA3KGF9 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc9bA3KGF9 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc9bA3KGF9 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc9bA3KGF9 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc9bA3KGF9 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc9bA3KGF9 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc9bA3KGF9 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc9bA3KGF9 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc9bA3KGF9 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc9bA3KGF9 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc9bA3KGF9 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc9bA3KGF9 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc9bA3KGF9 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc9bA3KGF9 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc9bA3KGF9 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc9bA3KGF9 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc9bA3KGF9 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc9bA3KGF9 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc9bA3KGF9 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc9bA3KGF9 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc9bA3KGF9 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc9bA3KGF9 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc9bA3KGF9 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc9bA3KGF9 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc9bA3KGF9 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc9bA3KGF9 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc9bA3KGF9 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc9bA3KGF9 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc9bA3KGF9 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc9bA3KGF9 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc9bA3KGF9 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc9bA3KGF9 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc9bA3KGF9 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc9bA3KGF9 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc9bA3KGF9 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc9bA3KGF9 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc9bA3KGF9 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc9bA3KGF9 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc9bA3KGF9 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc9bA3KGF9 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc9bA3KGF9 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc9bA3KGF9 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc9bA3KGF9 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc9bA3KGF9 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc9bA3KGF9 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc9bA3KGF9 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc9bA3KGF9 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc9bA3KGF9 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc9bA3KGF9 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc9bA3KGF9 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc9bA3KGF9 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc9bA3KGF9 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc9bA3KGF9 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc9bA3KGF9 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc9bA3KGF9 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc9bA3KGF9 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc9bA3KGF9 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc9bA3KGF9 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc9bA3KGF9 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc9bA3KGF9 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc9bA3KGF9 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc9bA3KGF9 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc9bA3KGF9 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc9bA3KGF9 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc9bA3KGF9 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc9bA3KGF9 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc9bA3KGF9 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc9bA3KGF9 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc9bA3KGF9 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc9bA3KGF9 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc9bA3KGF9 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc9bA3KGF9 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc9bA3KGF9 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc9bA3KGF9 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc9bA3KGF9 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc9bA3KGF9 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc9bA3KGF9 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc9bA3KGF9 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc9bA3KGF9 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc9bA3KGF9 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc9bA3KGF9 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc9bA3KGF9 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc9bA3KGF9 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc9bA3KGF9 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc9bA3KGF9 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc9bA3KGF9 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms