Protein–RNA interactions for Protein: A2AUC9

Klhl41, Kelch-like protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl41A2AUC9 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Klhl41A2AUC9 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Klhl41A2AUC9 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Klhl41A2AUC9 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Klhl41A2AUC9 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Klhl41A2AUC9 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Klhl41A2AUC9 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Klhl41A2AUC9 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Klhl41A2AUC9 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Klhl41A2AUC9 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Klhl41A2AUC9 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Klhl41A2AUC9 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Klhl41A2AUC9 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Klhl41A2AUC9 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Klhl41A2AUC9 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Klhl41A2AUC9 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Klhl41A2AUC9 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Klhl41A2AUC9 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Klhl41A2AUC9 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Klhl41A2AUC9 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Klhl41A2AUC9 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Klhl41A2AUC9 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Klhl41A2AUC9 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Klhl41A2AUC9 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Klhl41A2AUC9 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Klhl41A2AUC9 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Klhl41A2AUC9 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Klhl41A2AUC9 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Klhl41A2AUC9 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Klhl41A2AUC9 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Klhl41A2AUC9 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Klhl41A2AUC9 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Klhl41A2AUC9 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Klhl41A2AUC9 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Klhl41A2AUC9 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Klhl41A2AUC9 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Klhl41A2AUC9 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Klhl41A2AUC9 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Klhl41A2AUC9 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Klhl41A2AUC9 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Klhl41A2AUC9 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Klhl41A2AUC9 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Klhl41A2AUC9 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Klhl41A2AUC9 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Klhl41A2AUC9 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Klhl41A2AUC9 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Klhl41A2AUC9 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Klhl41A2AUC9 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Klhl41A2AUC9 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Klhl41A2AUC9 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Klhl41A2AUC9 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Klhl41A2AUC9 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Klhl41A2AUC9 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Klhl41A2AUC9 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Klhl41A2AUC9 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Klhl41A2AUC9 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Klhl41A2AUC9 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Klhl41A2AUC9 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Klhl41A2AUC9 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Klhl41A2AUC9 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Klhl41A2AUC9 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Klhl41A2AUC9 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Klhl41A2AUC9 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Klhl41A2AUC9 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Klhl41A2AUC9 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Klhl41A2AUC9 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Klhl41A2AUC9 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Klhl41A2AUC9 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Klhl41A2AUC9 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Klhl41A2AUC9 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Klhl41A2AUC9 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Klhl41A2AUC9 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Klhl41A2AUC9 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Klhl41A2AUC9 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Klhl41A2AUC9 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Klhl41A2AUC9 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Klhl41A2AUC9 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Klhl41A2AUC9 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Klhl41A2AUC9 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Klhl41A2AUC9 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Klhl41A2AUC9 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Klhl41A2AUC9 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Klhl41A2AUC9 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Klhl41A2AUC9 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Klhl41A2AUC9 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Klhl41A2AUC9 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Klhl41A2AUC9 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Klhl41A2AUC9 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Klhl41A2AUC9 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Klhl41A2AUC9 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Klhl41A2AUC9 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Klhl41A2AUC9 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Klhl41A2AUC9 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Klhl41A2AUC9 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Klhl41A2AUC9 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Klhl41A2AUC9 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Klhl41A2AUC9 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Klhl41A2AUC9 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Klhl41A2AUC9 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Klhl41A2AUC9 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms